Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
VWA3AA6NCI4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
VWA3AA6NCI4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWA3AA6NCI4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
VWA3AA6NCI4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWA3AA6NCI4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWA3AA6NCI4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
VWA3AA6NCI4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
VWA3AA6NCI4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
VWA3AA6NCI4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VWA3AA6NCI4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VWA3AA6NCI4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
VWA3AA6NCI4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VWA3AA6NCI4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
VWA3AA6NCI4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
VWA3AA6NCI4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
VWA3AA6NCI4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VWA3AA6NCI4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
VWA3AA6NCI4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
VWA3AA6NCI4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
VWA3AA6NCI4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VWA3AA6NCI4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
VWA3AA6NCI4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VWA3AA6NCI4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
VWA3AA6NCI4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
VWA3AA6NCI4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
VWA3AA6NCI4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
VWA3AA6NCI4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
VWA3AA6NCI4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
VWA3AA6NCI4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms