Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRD1A4D1F6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRD1A4D1F6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRD1A4D1F6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRD1A4D1F6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRD1A4D1F6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRD1A4D1F6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LRRD1A4D1F6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms