Protein–RNA interactions for Protein: A2NJV5

IGKV2-29, Immunoglobulin kappa variable 2-29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-29A2NJV5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV2-29A2NJV5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV2-29A2NJV5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV2-29A2NJV5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV2-29A2NJV5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGKV2-29A2NJV5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGKV2-29A2NJV5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGKV2-29A2NJV5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IGKV2-29A2NJV5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
IGKV2-29A2NJV5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms