Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3PXD2BA1X283 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
SH3PXD2BA1X283 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3PXD2BA1X283 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SH3PXD2BA1X283 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SH3PXD2BA1X283 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms