Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SF12

CCDC163, Coiled-coil domain-containing 163, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC163A0A0D9SF12 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC163A0A0D9SF12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC163A0A0D9SF12 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC163A0A0D9SF12 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC163A0A0D9SF12 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC163A0A0D9SF12 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC163A0A0D9SF12 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC163A0A0D9SF12 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC163A0A0D9SF12 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC163A0A0D9SF12 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC163A0A0D9SF12 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC163A0A0D9SF12 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC163A0A0D9SF12 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC163A0A0D9SF12 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC163A0A0D9SF12 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms