Protein–RNA interactions for Protein: A0A0C4DH31

IGHV1-18, Immunoglobulin heavy variable 1-18, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-18A0A0C4DH31 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGHV1-18A0A0C4DH31 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV1-18A0A0C4DH31 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV1-18A0A0C4DH31 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms