Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
J3KRW8 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
J3KRW8 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
J3KRW8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
J3KRW8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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