Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CRIP3Q6Q6R5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CRIP3Q6Q6R5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms