RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423421.5

CXorf40A-204, Transcript of chromosome X open reading frame 40A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXorf40A, Length 1,403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXorf40A-204ENST00000423421 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.23■■■■■ 5.31
CXorf40A-204ENST00000423421 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa42.63■■■■■ 4.41
CXorf40A-204ENST00000423421 ABCC9O60706 1549 aa41.08■■■■■ 4.17
CXorf40A-204ENST00000423421 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
CXorf40A-204ENST00000423421 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.18■■■■■ 4.02
CXorf40A-204ENST00000423421 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.98■■■■□ 3.99
CXorf40A-204ENST00000423421 NACADO15069 1562 aa39.97■■■■□ 3.99
CXorf40A-204ENST00000423421 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.95■■■■□ 3.99
CXorf40A-204ENST00000423421 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.88■■■■□ 3.97
CXorf40A-204ENST00000423421 SCRIBQ14160 1630 aa38.89■■■■□ 3.82
CXorf40A-204ENST00000423421 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.81■■■■□ 3.8
CXorf40A-204ENST00000423421 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.5■■■■□ 3.75
CXorf40A-204ENST00000423421 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.48■■■■□ 3.75
CXorf40A-204ENST00000423421 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.45■■■■□ 3.75
CXorf40A-204ENST00000423421 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
CXorf40A-204ENST00000423421 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.43■■■■□ 3.58
CXorf40A-204ENST00000423421 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
CXorf40A-204ENST00000423421 SMARCA4P51532 1647 aa37.27■■■■□ 3.56
CXorf40A-204ENST00000423421 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.19■■■■□ 3.54
CXorf40A-204ENST00000423421 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.12■■■■□ 3.53
CXorf40A-204ENST00000423421 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.05■■■■□ 3.52
CXorf40A-204ENST00000423421 SMARCA2P51531 1590 aa37■■■■□ 3.51
CXorf40A-204ENST00000423421 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.96■■■■□ 3.51
CXorf40A-204ENST00000423421 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.93■■■■□ 3.5
CXorf40A-204ENST00000423421 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.91■■■■□ 3.5
CXorf40A-204ENST00000423421 NCAPD3P42695 1498 aa36.85■■■■□ 3.49
CXorf40A-204ENST00000423421 WIZO95785 1651 aa36.75■■■■□ 3.47
CXorf40A-204ENST00000423421 HMGXB3Q12766 1538 aa36.73■■■■□ 3.47
CXorf40A-204ENST00000423421 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.72■■■■□ 3.47
CXorf40A-204ENST00000423421 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
CXorf40A-204ENST00000423421 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.46■■■■□ 3.43
CXorf40A-204ENST00000423421 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.02■■■■□ 3.36
CXorf40A-204ENST00000423421 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.84■■■■□ 3.33
CXorf40A-204ENST00000423421 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.81■■■■□ 3.32
CXorf40A-204ENST00000423421 CFTRP13569 1480 aa35.72■■■■□ 3.31
CXorf40A-204ENST00000423421 NESP48681 1621 aa35.68■■■■□ 3.3
CXorf40A-204ENST00000423421 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.61■■■■□ 3.29
CXorf40A-204ENST00000423421 ERCC6Q03468 1493 aa35.48■■■■□ 3.27
CXorf40A-204ENST00000423421 PRDM2Q13029 1718 aa35.47■■■■□ 3.27
CXorf40A-204ENST00000423421 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.4■■■■□ 3.26
CXorf40A-204ENST00000423421 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.33■■■■□ 3.25
CXorf40A-204ENST00000423421 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.29■■■■□ 3.24
CXorf40A-204ENST00000423421 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.12■■■■□ 3.21
CXorf40A-204ENST00000423421 ABCC8Q09428 1581 aa35.05■■■■□ 3.2
CXorf40A-204ENST00000423421 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
CXorf40A-204ENST00000423421 WDR62O43379 1518 aa34.94■■■■□ 3.18
CXorf40A-204ENST00000423421 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.93■■■■□ 3.18
CXorf40A-204ENST00000423421 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.9■■■■□ 3.18
CXorf40A-204ENST00000423421 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.18
CXorf40A-204ENST00000423421 TOPBP1Q92547 1522 aa34.88■■■■□ 3.17
CXorf40A-204ENST00000423421 CUX2O14529 1486 aa34.85■■■■□ 3.17
CXorf40A-204ENST00000423421 CUX1P39880 1505 aa34.79■■■■□ 3.16
CXorf40A-204ENST00000423421 TOP2BQ02880 1626 aa34.72■■■■□ 3.15
CXorf40A-204ENST00000423421 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.69■■■■□ 3.14
CXorf40A-204ENST00000423421 SYNJ1O43426 1573 aa34.67■■■■□ 3.14
CXorf40A-204ENST00000423421 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.63■■■■□ 3.13
CXorf40A-204ENST00000423421 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.62■■■■□ 3.13
CXorf40A-204ENST00000423421 TRIM41Q8WV44 630 aa34.6■■■■□ 3.13
CXorf40A-204ENST00000423421 IFT140Q96RY7 1462 aa34.57■■■■□ 3.12
CXorf40A-204ENST00000423421 SOGA1O94964 1423 aa34.56■■■■□ 3.12
CXorf40A-204ENST00000423421 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.47■■■■□ 3.11
CXorf40A-204ENST00000423421 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.43■■■■□ 3.1
CXorf40A-204ENST00000423421 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.41■■■■□ 3.1
CXorf40A-204ENST00000423421 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.35■■■■□ 3.09
CXorf40A-204ENST00000423421 WDR97A6NE52 1622 aa34.29■■■■□ 3.08
CXorf40A-204ENST00000423421 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.24■■■■□ 3.07
CXorf40A-204ENST00000423421 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.23■■■■□ 3.07
CXorf40A-204ENST00000423421 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.18■■■■□ 3.06
CXorf40A-204ENST00000423421 KIF27Q86VH2 1401 aa34.17■■■■□ 3.06
CXorf40A-204ENST00000423421 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.17■■■■□ 3.06
CXorf40A-204ENST00000423421 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.15■■■■□ 3.06
CXorf40A-204ENST00000423421 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.1■■■■□ 3.05
CXorf40A-204ENST00000423421 GRIN2BQ13224 1484 aa34.08■■■■□ 3.05
CXorf40A-204ENST00000423421 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.98■■■■□ 3.03
CXorf40A-204ENST00000423421 EEA1Q15075 1411 aa33.98■■■■□ 3.03
CXorf40A-204ENST00000423421 PBRM1Q86U86 1689 aa33.97■■■■□ 3.03
CXorf40A-204ENST00000423421 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.93■■■■□ 3.02
CXorf40A-204ENST00000423421 IGF1RP08069 1367 aa33.88■■■■□ 3.01
CXorf40A-204ENST00000423421 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.88■■■■□ 3.01
CXorf40A-204ENST00000423421 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.86■■■■□ 3.01
CXorf40A-204ENST00000423421 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.8■■■■□ 3
CXorf40A-204ENST00000423421 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.8■■■■□ 3
CXorf40A-204ENST00000423421 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.8■■■■□ 3
CXorf40A-204ENST00000423421 CUL7Q14999 1698 aa33.79■■■■□ 3
CXorf40A-204ENST00000423421 FBLN2P98095 1184 aa33.79■■■■□ 3
CXorf40A-204ENST00000423421 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.78■■■■□ 3
CXorf40A-204ENST00000423421 SYNJ2O15056 1496 aa33.78■■■■□ 3
CXorf40A-204ENST00000423421 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa33.74■■■□□ 2.99
CXorf40A-204ENST00000423421 ADAMTS12P58397 1594 aa33.73■■■□□ 2.99
CXorf40A-204ENST00000423421 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa33.61■■■□□ 2.97
CXorf40A-204ENST00000423421 GRIN2AQ12879 1464 aa33.6■■■□□ 2.97
CXorf40A-204ENST00000423421 CHD1O14646 1710 aa33.6■■■□□ 2.97
CXorf40A-204ENST00000423421 OSCARQ8IYS5 282 aa33.6■■■□□ 2.97
CXorf40A-204ENST00000423421 PRXQ9BXM0 1461 aa33.57■■■□□ 2.97
CXorf40A-204ENST00000423421 KIF21BO75037 1637 aa33.45■■■□□ 2.95
CXorf40A-204ENST00000423421 NUP160Q12769 1436 aa33.41■■■□□ 2.94
CXorf40A-204ENST00000423421 GOLGA3Q08378 1498 aa33.36■■■□□ 2.93
CXorf40A-204ENST00000423421 CEP170Q5SW79 1584 aa33.34■■■□□ 2.93
CXorf40A-204ENST00000423421 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa33.3■■■□□ 2.92
CXorf40A-204ENST00000423421 UBTFP17480 764 aaKnown RBP33.3■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.8 ms