Protein–RNA interactions for Protein: Q12199

TIP41, Type 2A phosphatase activator TIP41, yeastyeast

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIP41Q12199 YIL032CYIL032C 357 nt1.99□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 YIL059CYIL059C 366 nt1.99□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.99□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 HHT1YBR010W 411 nt1.99□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 YBR064WYBR064W 429 nt1.99□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 YPR063CYPR063C 423 nt1.99□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 YHL042WYHL042W 453 nt1.98□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 PAM16YJL104W 450 nt1.98□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.98□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 SNC2YOR327C 348 nt1.98□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 NUT2YPR168W 474 nt1.98□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 TOF2YKR010C 2316 nt1.98□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 GUP1YGL084C 1683 nt1.98□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 SPO22YIL073C 2928 nt1.98□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 DOT6YER088C 2013 nt1.98□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 MYO2YOR326W 4725 nt1.98□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 RTP1YMR185W 2946 nt1.97□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 NPC2YDL046W 522 nt1.97□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 RPA34YJL148W 702 nt1.97□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 RPS27AYKL156W 249 nt1.97□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 IRR1YIL026C 3453 nt1.97□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 DFG16YOR030W 1860 nt1.97□□□□□ -2.09
TIP41Q12199 CBF2YGR140W 2871 nt1.96□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 ACB1YGR037C 264 nt1.96□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 YLR255CYLR255C 354 nt1.96□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 YNL198CYNL198C 303 nt1.96□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.96□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 CFT1YDR301W 4074 nt1.95□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 MGA2YIR033W 3342 nt1.95□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 YOR333CYOR333C 417 nt1.95□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 GIP3YPL137C 3831 nt1.95□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 NPR2YEL062W 1848 nt1.95□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 RTT101YJL047C 2529 nt1.95□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 SOK2YMR016C 2358 nt1.95□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 FMP16YDR070C 282 nt1.94□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 UPS1YLR193C 528 nt1.94□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 MVP1YMR004W 1536 nt1.94□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 SCW11YGL028C 1629 nt1.94□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 STB4YMR019W 2850 nt1.94□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.93□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 YLR149CYLR149C 2193 nt1.92□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 VPS16YPL045W 2397 nt1.92□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 IES4YOR189W 351 nt1.92□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 YBR224WYBR224W 516 nt1.92□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 YBR277CYBR277C 402 nt1.92□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 RTT107YHR154W 3213 nt1.91□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 NOP53YPL146C 1368 nt1.91□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 YDR426CYDR426C 378 nt1.91□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 PCC1YKR095W-A 267 nt1.91□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.91□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 SEF1YBL066C 3447 nt1.91□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 HDA3YPR179C 1968 nt1.9□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 ATG9YDL149W 2994 nt1.9□□□□□ -2.1
TIP41Q12199 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.9□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 GPG1YGL121C 381 nt1.9□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 TRX1YLR043C 312 nt1.9□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.9□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YOR302WYOR302W 78 nt1.9□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 CDC27YBL084C 2277 nt1.9□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 PXA2YKL188C 2562 nt1.9□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 KIP1YBL063W 3336 nt1.89□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 VPH1YOR270C 2523 nt1.89□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 SAC3YDR159W 3906 nt1.89□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.89□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 CYB5YNL111C 363 nt1.89□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YOR015WYOR015W 360 nt1.89□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 HER1YOR227W 3741 nt1.89□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 LRE1YCL051W 1752 nt1.89□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 CDC53YDL132W 2448 nt1.89□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 VPS8YAL002W 3825 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 BUD2YKL092C 3315 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YOR093CYOR093C 4947 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YGR250CYGR250C 2346 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 TUS1YLR425W 3924 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 snR55snR55 98 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 snR60snR60 104 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YJL182CYJL182C 318 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 TMA7YLR262C-A 195 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 LCD1YDR499W 2244 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 PEP3YLR148W 2757 nt1.88□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 TRM3YDL112W 4311 nt1.87□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 RIC1YLR039C 3171 nt1.87□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 ISD11YER048W-A 285 nt1.87□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.87□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 SNC1YAL030W 354 nt1.87□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YNL114CYNL114C 372 nt1.87□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YMR045CYMR045C 5268 nt1.87□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 CDC60YPL160W 3273 nt1.86□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YBR184WYBR184W 1572 nt1.86□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 PLC1YPL268W 2610 nt1.86□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 PAU2YEL049W 363 nt1.86□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YGL052WYGL052W 306 nt1.86□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 INA22YIR024C 651 nt1.86□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 PFD1YJL179W 330 nt1.86□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 PDR8YLR266C 2106 nt1.86□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 DNF3YMR162C 4971 nt1.86□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 NIP100YPL174C 2607 nt1.85□□□□□ -2.11
TIP41Q12199 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.85□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.8 ms