Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 FKS1YLR342W 5631 nt2.1□□□□□ -2.07
DSE3Q08729 HDA3YPR179C 1968 nt2.1□□□□□ -2.07
DSE3Q08729 TOF2YKR010C 2316 nt2.09□□□□□ -2.07
DSE3Q08729 NPC2YDL046W 522 nt2.09□□□□□ -2.07
DSE3Q08729 YHL042WYHL042W 453 nt2.09□□□□□ -2.07
DSE3Q08729 YMR272W-BYMR272W-B 108 nt2.09□□□□□ -2.07
DSE3Q08729 IES4YOR189W 351 nt2.09□□□□□ -2.07
DSE3Q08729 YPR063CYPR063C 423 nt2.09□□□□□ -2.07
DSE3Q08729 NUT2YPR168W 474 nt2.09□□□□□ -2.07
DSE3Q08729 STH1YIL126W 4080 nt2.09□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 RIM20YOR275C 1986 nt2.09□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 NPR2YEL062W 1848 nt2.08□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YDL118WYDL118W 381 nt2.08□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 UPS1YLR193C 528 nt2.08□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 HHT1YBR010W 411 nt2.08□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YBR224WYBR224W 516 nt2.08□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 MVP1YMR004W 1536 nt2.07□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 snR60snR60 104 nt2.07□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YBR277CYBR277C 402 nt2.07□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 RPL38YLR325C 237 nt2.06□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 RPS17AYML024W 411 nt2.06□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.06□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 SPO22YIL073C 2928 nt2.06□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 ELG1YOR144C 2376 nt2.06□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 TUS1YLR425W 3924 nt2.05□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YGR250CYGR250C 2346 nt2.05□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 snR55snR55 98 nt2.05□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 FMP16YDR070C 282 nt2.05□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YDR426CYDR426C 378 nt2.05□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 GPG1YGL121C 381 nt2.05□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.05□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.05□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.05□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YOR302WYOR302W 78 nt2.05□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 NOP53YPL146C 1368 nt2.05□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 ACB1YGR037C 264 nt2.04□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 SNC1YAL030W 354 nt2.04□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 VPS34YLR240W 2628 nt2.04□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 STB4YMR019W 2850 nt2.04□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 SEF1YBL066C 3447 nt2.04□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 CYB5YNL111C 363 nt2.04□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YOR333CYOR333C 417 nt2.04□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 VPS16YPL045W 2397 nt2.04□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 TOR2YKL203C 7425 nt2.04□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 NOP14YDL148C 2433 nt2.03□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YLR149CYLR149C 2193 nt2.03□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 SCW11YGL028C 1629 nt2.03□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 AGC1YPR021C 2709 nt2.03□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 ISD11YER048W-A 285 nt2.03□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 PFD1YJL179W 330 nt2.03□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 PCC1YKR095W-A 267 nt2.03□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt2.03□□□□□ -2.08
DSE3Q08729 PAU2YEL049W 363 nt2.02□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 ANS1YHR126C 480 nt2.02□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 ATG9YDL149W 2994 nt2.02□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 VMR1YHL035C 4779 nt2.02□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 PXA2YKL188C 2562 nt2.02□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YEL043WYEL043W 2871 nt2.01□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 CBF2YGR140W 2871 nt2.01□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 BUD2YKL092C 3315 nt2.01□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 PEP3YLR148W 2757 nt2.01□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 CDC27YBL084C 2277 nt2.01□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 INA22YIR024C 651 nt2.01□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.01□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.01□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 SSS1YDR086C 243 nt2□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YJL182CYJL182C 318 nt2□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YNL114CYNL114C 372 nt2□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 CSE2YNR010W 450 nt2□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YOR015WYOR015W 360 nt2□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 GRR1YJR090C 3456 nt2□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YBR184WYBR184W 1572 nt2□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YGL052WYGL052W 306 nt1.99□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.99□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YNL028WYNL028W 318 nt1.99□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YBL083CYBL083C 426 nt1.99□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 RIC1YLR039C 3171 nt1.99□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt1.98□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.98□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 EFR3YMR212C 2349 nt1.98□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 LCD1YDR499W 2244 nt1.98□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 RRP6YOR001W 2202 nt1.98□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 CFT2YLR115W 2580 nt1.98□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 SMY1YKL079W 1971 nt1.98□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 VPH1YOR270C 2523 nt1.97□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 Q0092Q0092 141 nt1.97□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 RPL42BYHR141C 321 nt1.97□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YJL135WYJL135W 318 nt1.97□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 RPL42AYNL162W 321 nt1.97□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 YOL160WYOL160W 342 nt1.97□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 IRC20YLR247C 4671 nt1.97□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 PLC1YPL268W 2610 nt1.97□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 CFT1YDR301W 4074 nt1.96□□□□□ -2.09
DSE3Q08729 TRX1YLR043C 312 nt1.96□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.96□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.96□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 YMR321CYMR321C 318 nt1.96□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.96□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 CRM1YGR218W 3255 nt1.96□□□□□ -2.1
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