Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PFDN5Q99471 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PFDN5Q99471 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms