Protein–RNA interactions for Protein: Q12317

MSB4, GTPase-activating protein MSB4, yeastyeast

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Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSB4Q12317 OSH3YHR073W 2991 nt4.15□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 APE2YKL157W 2859 nt4.15□□□□□ -1.74
MSB4Q12317 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt4.15□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt4.15□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 STE6YKL209C 3873 nt4.15□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 GRR1YJR090C 3456 nt4.15□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 STE11YLR362W 2154 nt4.14□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 EDS1YBR033W 2760 nt4.14□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 YNL018CYNL018C 1839 nt4.14□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 MSH2YOL090W 2895 nt4.14□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 FLO10YKR102W 3510 nt4.14□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 PRP5YBR237W 2550 nt4.13□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 QCR9YGR183C 201 nt4.13□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt4.13□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt4.13□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 RPN2YIL075C 2838 nt4.13□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt4.12□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 RPS30BYOR182C 192 nt4.12□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 UTP14YML093W 2700 nt4.12□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 SPT16YGL207W 3108 nt4.11□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 SYT1YPR095C 3681 nt4.1□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 RCY1YJL204C 2523 nt4.1□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 PHM6YDR281C 315 nt4.1□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 NUP159YIL115C 4383 nt4.1□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 PWP2YCR057C 2772 nt4.09□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt4.09□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 SIN3YOL004W 4611 nt4.09□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 SOK1YDR006C 2706 nt4.09□□□□□ -1.75
MSB4Q12317 SLM1YIL105C 2061 nt4.08□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 HSH155YMR288W 2916 nt4.08□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 YBL071C-BYBL071C-B 99 nt4.08□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 POL3YDL102W 3294 nt4.07□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 RPS12YOR369C 432 nt4.07□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 RPS23BYPR132W 438 nt4.07□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 IRC8YJL051W 2469 nt4.07□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 TAF1YGR274C 3201 nt4.07□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 DBP10YDL031W 2988 nt4.06□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 PIP2YOR363C 2991 nt4.06□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 TRS120YDR407C 3870 nt4.06□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 CAF130YGR134W 3369 nt4.05□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 APC11YDL008W 498 nt4.05□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 RPL23BYER117W 414 nt4.05□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 COX12YLR038C 252 nt4.05□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 RPL42AYNL162W 321 nt4.05□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 RSM19YNR037C 276 nt4.05□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 snR39BsnR39B 96 nt4.05□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 YLL054CYLL054C 2532 nt4.04□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 MNE1YOR350C 1992 nt4.04□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 snR50snR50 90 nt4.04□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 CIN1YOR349W 3045 nt4.03□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 snR64snR64 101 nt4.03□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 YMR31YFR049W 372 nt4.03□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 RAD26YJR035W 3258 nt4.03□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 MPH1YIR002C 2982 nt4.03□□□□□ -1.76
MSB4Q12317 GLG1YKR058W 1851 nt4.03□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 SSM4YIL030C 3960 nt4.03□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 SEF1YBL066C 3447 nt4.02□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 YLR352WYLR352W 2424 nt4.02□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 APL1YJR005W 2103 nt4.02□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt4.02□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 ALA1YOR335C 2877 nt4.02□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 XRS2YDR369C 2565 nt4.02□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 SWI6YLR182W 2412 nt4.01□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 YTA7YGR270W 4140 nt4.01□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 HMI1YOL095C 2121 nt4□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt4□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt4□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 YLR416CYLR416C 399 nt4□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 YBR072C-AYBR072C-A 162 nt4□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 BNI4YNL233W 2679 nt4□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 VPS35YJL154C 2835 nt4□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 YCG1YDR325W 3108 nt3.99□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 MDN1YLR106C 14733 nt3.99□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 DIA2YOR080W 2199 nt3.99□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 YOR296WYOR296W 3870 nt3.99□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 SNF5YBR289W 2718 nt3.99□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt3.99□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 STB6YKL072W 2301 nt3.99□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 SBE22YHR103W 2559 nt3.99□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 MTR4YJL050W 3222 nt3.99□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 YGL182CYGL182C 324 nt3.98□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 RPS26AYGL189C 360 nt3.98□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 RPH1YER169W 2391 nt3.98□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 NTO1YPR031W 2247 nt3.98□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 SAK1YER129W 3429 nt3.98□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 NAB6YML117W 3405 nt3.97□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 CPA2YJR109C 3357 nt3.97□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 FAP7YDL166C 594 nt3.97□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 RSE1YML049C 4086 nt3.97□□□□□ -1.77
MSB4Q12317 SNT1YCR033W 3681 nt3.96□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt3.96□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 ANB1YJR047C 474 nt3.96□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 FLO5YHR211W 3228 nt3.96□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 TMA108YIL137C 2841 nt3.94□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 XRN1YGL173C 4587 nt3.94□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 DAN4YJR151C 3486 nt3.94□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 ZDS2YML109W 2829 nt3.94□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 YBL100W-CYBL100W-C 120 nt3.94□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 UBP1YDL122W 2430 nt3.93□□□□□ -1.78
MSB4Q12317 TFC1YBR123C 1950 nt3.93□□□□□ -1.78
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