RNA–Protein interactions for RNA: YML093W

UTP14, Transcript of Subunit of U3-containing Small Subunit (SSU) processome complex, yeast

Gene UTP14, Length 2,700 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UTP14	YML093W	FAP1	P53971	965 aa		6.68	□□□□□ -1.34
UTP14	YML093W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
UTP14	YML093W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
UTP14	YML093W	PRY3	P47033	881 aa		6.24	□□□□□ -1.41
UTP14	YML093W	AAD16	Q02895	342 aa		5.93	□□□□□ -1.46
UTP14	YML093W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
UTP14	YML093W	PRI1	P10363	409 aa		5.79	□□□□□ -1.48
UTP14	YML093W	ISW2	Q08773	1120 aa		5.71	□□□□□ -1.49
UTP14	YML093W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	5.6	□□□□□ -1.51
UTP14	YML093W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	5.54	□□□□□ -1.52
UTP14	YML093W	YCK3	P39962	524 aa		5.5	□□□□□ -1.53
UTP14	YML093W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.53
UTP14	YML093W	MRPL32	P25348	183 aa		5.43	□□□□□ -1.54
UTP14	YML093W	AVT3	P36062	692 aa		5.39	□□□□□ -1.55
UTP14	YML093W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
UTP14	YML093W	YGL015C	P33199	130 aa		5.27	□□□□□ -1.57
UTP14	YML093W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
UTP14	YML093W	REB1	P21538	810 aa		5.2	□□□□□ -1.58
UTP14	YML093W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
UTP14	YML093W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
UTP14	YML093W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
UTP14	YML093W	SPT21	P35209	758 aa		4.9	□□□□□ -1.62
UTP14	YML093W	TFA1	P36100	482 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UTP14	YML093W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UTP14	YML093W	CDC27	P38042	758 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UTP14	YML093W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UTP14	YML093W	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
UTP14	YML093W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
UTP14	YML093W	UBP9	P39967	754 aa		4.81	□□□□□ -1.64
UTP14	YML093W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UTP14	YML093W	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
UTP14	YML093W	RIM101	P33400	625 aa		4.76	□□□□□ -1.65
UTP14	YML093W	HO	P09932	586 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UTP14	YML093W	TAF7	Q05021	590 aa		4.73	□□□□□ -1.65
UTP14	YML093W	SCY1	P53009	804 aa		4.72	□□□□□ -1.65
UTP14	YML093W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
UTP14	YML093W	DCD1	P06773	312 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UTP14	YML093W	TFC8	Q12308	588 aa		4.68	□□□□□ -1.66
UTP14	YML093W	TGL3	P40308	642 aa		4.65	□□□□□ -1.66
UTP14	YML093W	OXP1	P28273	1286 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UTP14	YML093W	BCH2	P36122	765 aa		4.54	□□□□□ -1.68
UTP14	YML093W	YOR238W	Q08634	303 aa		4.45	□□□□□ -1.7
UTP14	YML093W	YLR271W	Q06152	274 aa		4.44	□□□□□ -1.7
UTP14	YML093W	PTP3	P40048	928 aa		4.44	□□□□□ -1.7
UTP14	YML093W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
UTP14	YML093W	YJL171C	P46992	396 aa		4.44	□□□□□ -1.7
UTP14	YML093W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
UTP14	YML093W	RSM7	P47150	247 aa		4.42	□□□□□ -1.7
UTP14	YML093W	YBL029C-A	Q3E756	94 aa		4.42	□□□□□ -1.7
UTP14	YML093W	EPS1	P40557	701 aa		4.42	□□□□□ -1.7
UTP14	YML093W	BDF1	P35817	686 aa		4.41	□□□□□ -1.7
UTP14	YML093W	GTT3	P39996	337 aa		4.41	□□□□□ -1.7
UTP14	YML093W	SPP1	Q03012	353 aa		4.4	□□□□□ -1.71
UTP14	YML093W	WSC3	Q12215	556 aa		4.4	□□□□□ -1.71
UTP14	YML093W	SSP1	P38871	571 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTP14	YML093W	AI2	P03876	854 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTP14	YML093W	BBC1	P47068	1157 aa		4.38	□□□□□ -1.71
UTP14	YML093W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
UTP14	YML093W	YAP5	P40574	245 aa		4.34	□□□□□ -1.71
UTP14	YML093W	VNX1	P42839	908 aa		4.32	□□□□□ -1.72
UTP14	YML093W	CST9	Q06032	482 aa		4.3	□□□□□ -1.72
UTP14	YML093W	MST1	P07236	462 aa		4.28	□□□□□ -1.72
UTP14	YML093W	TIF11	P38912	153 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
UTP14	YML093W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.27	□□□□□ -1.73	not detected
UTP14	YML093W	MGA2	P40578	1113 aa		4.26	□□□□□ -1.73
UTP14	YML093W	BMT6	Q12291	365 aa		4.24	□□□□□ -1.73
UTP14	YML093W	NSR1	P27476	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.24	□□□□□ -1.73	not detected
UTP14	YML093W	DMA1	P38823	416 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UTP14	YML093W	MRM1	P25270	412 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UTP14	YML093W	ULI1	P43604	169 aa		4.23	□□□□□ -1.73
UTP14	YML093W	FKH1	P40466	484 aa		4.22	□□□□□ -1.73
UTP14	YML093W	RCR1	P38212	213 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UTP14	YML093W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
UTP14	YML093W	LDB19	Q12502	818 aa		4.2	□□□□□ -1.74
UTP14	YML093W	LEO1	P38439	464 aa		4.19	□□□□□ -1.74
UTP14	YML093W	PIB1	Q06651	286 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UTP14	YML093W	VPS29	P38759	282 aa		4.18	□□□□□ -1.74
UTP14	YML093W	TFG1	P41895	735 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
UTP14	YML093W	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
UTP14	YML093W	RTG3	P38165	486 aa		4.14	□□□□□ -1.75
UTP14	YML093W	STS1	P38637	319 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UTP14	YML093W	MSB4	Q12317	492 aa		4.12	□□□□□ -1.75
UTP14	YML093W	RTG1	P32607	177 aa		4.11	□□□□□ -1.75
UTP14	YML093W	RAM2	P29703	316 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UTP14	YML093W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.1	□□□□□ -1.75	not detected
UTP14	YML093W	NCR1	Q12200	1170 aa		4.1	□□□□□ -1.75
UTP14	YML093W	SET4	P42948	560 aa		4.09	□□□□□ -1.75
UTP14	YML093W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UTP14	YML093W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
UTP14	YML093W	YFR006W	P43590	535 aa		4.08	□□□□□ -1.76
UTP14	YML093W	IOC2	Q12072	812 aa		4.07	□□□□□ -1.76
UTP14	YML093W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
UTP14	YML093W	YOL036W	Q08206	761 aa		4.05	□□□□□ -1.76
UTP14	YML093W	AIM44	Q99299	758 aa		4.04	□□□□□ -1.76
UTP14	YML093W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
UTP14	YML093W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
UTP14	YML093W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
UTP14	YML093W	SEC61	P32915	480 aa		4.03	□□□□□ -1.76
UTP14	YML093W	SAP30	P38429	201 aa		4.01	□□□□□ -1.77
UTP14	YML093W	BCK2	P33306	851 aa		4.01	□□□□□ -1.77

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