RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
YMR31	YFR049W	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
YMR31	YFR049W	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	6.4	□□□□□ -1.38
YMR31	YFR049W	TFA1	P36100	482 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YMR31	YFR049W	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
YMR31	YFR049W	AVT3	P36062	692 aa		5.94	□□□□□ -1.46
YMR31	YFR049W	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	5.76	□□□□□ -1.49
YMR31	YFR049W	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	5.52	□□□□□ -1.53
YMR31	YFR049W	FAP1	P53971	965 aa		5.51	□□□□□ -1.53
YMR31	YFR049W	ISW2	Q08773	1120 aa		5.39	□□□□□ -1.55
YMR31	YFR049W	DMA1	P38823	416 aa		5.35	□□□□□ -1.55
YMR31	YFR049W	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
YMR31	YFR049W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YMR31	YFR049W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	5.31	□□□□□ -1.56
YMR31	YFR049W	PTP3	P40048	928 aa		5.27	□□□□□ -1.57
YMR31	YFR049W	REB1	P21538	810 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YMR31	YFR049W	PRY3	P47033	881 aa		5.22	□□□□□ -1.57
YMR31	YFR049W	TAF7	Q05021	590 aa		5.17	□□□□□ -1.58
YMR31	YFR049W	PRI1	P10363	409 aa		5.14	□□□□□ -1.59
YMR31	YFR049W	RIM101	P33400	625 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMR31	YFR049W	SSP1	P38871	571 aa		5.09	□□□□□ -1.59
YMR31	YFR049W	SPT21	P35209	758 aa		5.06	□□□□□ -1.6
YMR31	YFR049W	YAH1	Q12184	172 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
YMR31	YFR049W	LEO1	P38439	464 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMR31	YFR049W	AAD16	Q02895	342 aa		5.02	□□□□□ -1.61
YMR31	YFR049W	ARP8	Q12386	881 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.98	□□□□□ -1.61	not detected
YMR31	YFR049W	OXP1	P28273	1286 aa		4.97	□□□□□ -1.61
YMR31	YFR049W	YCK3	P39962	524 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YMR31	YFR049W	YIL055C	P40523	627 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YMR31	YFR049W	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YMR31	YFR049W	YLR271W	Q06152	274 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YMR31	YFR049W	MGA2	P40578	1113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YMR31	YFR049W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YMR31	YFR049W	RSM7	P47150	247 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YMR31	YFR049W	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YMR31	YFR049W	LEU3	P08638	886 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YMR31	YFR049W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YMR31	YFR049W	HO	P09932	586 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMR31	YFR049W	CST9	Q06032	482 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YMR31	YFR049W	MRPL32	P25348	183 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YMR31	YFR049W	DCD1	P06773	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMR31	YFR049W	TFC8	Q12308	588 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMR31	YFR049W	AI2	P03876	854 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YMR31	YFR049W	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YMR31	YFR049W	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YMR31	YFR049W	PSD2	P53037	1138 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
YMR31	YFR049W	DMA2	P53924	522 aa		4.71	□□□□□ -1.66
YMR31	YFR049W	BBC1	P47068	1157 aa		4.68	□□□□□ -1.66
YMR31	YFR049W	SET1	P38827	1080 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
YMR31	YFR049W	VPS70	P47161	811 aa		4.66	□□□□□ -1.66
YMR31	YFR049W	RAM2	P29703	316 aa		4.65	□□□□□ -1.67
YMR31	YFR049W	CDC27	P38042	758 aa		4.64	□□□□□ -1.67
YMR31	YFR049W	BCH2	P36122	765 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR31	YFR049W	CKB1	P43639	278 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YMR31	YFR049W	MRM1	P25270	412 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YMR31	YFR049W	RCR1	P38212	213 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YMR31	YFR049W	IFH1	P39520	1085 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR31	YFR049W	EPS1	P40557	701 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YMR31	YFR049W	YPR148C	Q06523	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
YMR31	YFR049W	RTG3	P38165	486 aa		4.56	□□□□□ -1.68
YMR31	YFR049W	RLF2	Q12495	606 aa		4.55	□□□□□ -1.68
YMR31	YFR049W	PBS2	P08018	668 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR31	YFR049W	BDF1	P35817	686 aa		4.54	□□□□□ -1.68
YMR31	YFR049W	MAK11	P20484	414 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
YMR31	YFR049W	KIN1	P13185	1064 aa		4.52	□□□□□ -1.69
YMR31	YFR049W	ABP1	P15891	592 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
YMR31	YFR049W	DSF2	P38213	736 aa		4.51	□□□□□ -1.69
YMR31	YFR049W	SCY1	P53009	804 aa		4.5	□□□□□ -1.69
YMR31	YFR049W	COQ8	P27697	501 aa		4.49	□□□□□ -1.69
YMR31	YFR049W	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
YMR31	YFR049W	GLC3	P32775	704 aa		4.48	□□□□□ -1.69
YMR31	YFR049W	HGH1	P48362	394 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
YMR31	YFR049W	MIF2	P35201	549 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YMR31	YFR049W	MAM3	Q12296	706 aa		4.47	□□□□□ -1.69
YMR31	YFR049W	IES2	P40154	320 aa		4.46	□□□□□ -1.7
YMR31	YFR049W	VPS29	P38759	282 aa		4.45	□□□□□ -1.7
YMR31	YFR049W	REF2	P42073	533 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
YMR31	YFR049W	DIT2	P21595	489 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YMR31	YFR049W	ATF2	P53296	535 aa		4.43	□□□□□ -1.7
YMR31	YFR049W	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
YMR31	YFR049W	AIM7	Q12156	149 aa		4.42	□□□□□ -1.7
YMR31	YFR049W	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
YMR31	YFR049W	YFR006W	P43590	535 aa		4.41	□□□□□ -1.7
YMR31	YFR049W	YMR1	P47147	688 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.41	□□□□□ -1.7	not detected
YMR31	YFR049W	DBP1	P24784	617 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	NOP53	Q12080	455 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	EDS1	P38073	919 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	STS1	P38637	319 aa		4.39	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	COX6	P00427	148 aa		4.37	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	MAK21	Q12176	1025 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	PTC3	P34221	468 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	YOR238W	Q08634	303 aa		4.35	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	YGL015C	P33199	130 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	VHR2	P40041	505 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	TFB3	Q03290	321 aa		4.34	□□□□□ -1.71
YMR31	YFR049W	PIB1	Q06651	286 aa		4.33	□□□□□ -1.72
YMR31	YFR049W	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	4.32	□□□□□ -1.72

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