RNA–Protein interactions for RNA: 21S_rRNA

21S_rRNA, Mitochondrial 21S rRNA, yeastyeast

Gene 21S_rRNA, Length 3,296 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
21S_rRNA21S_rRNA DRS1P32892 752 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
21S_rRNA21S_rRNA MTC1P47018 478 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
21S_rRNA21S_rRNA BFR2Q06631 534 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
21S_rRNA21S_rRNA TFA1P36100 482 aa6.9□□□□□ -1.31
21S_rRNA21S_rRNA AVT3P36062 692 aa6.41□□□□□ -1.38
21S_rRNA21S_rRNA DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
21S_rRNA21S_rRNA RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
21S_rRNA21S_rRNA DMA1P38823 416 aa6.05□□□□□ -1.44
21S_rRNA21S_rRNA TAF7Q05021 590 aa6.03□□□□□ -1.44
21S_rRNA21S_rRNA PTP3P40048 928 aa5.8□□□□□ -1.48
21S_rRNA21S_rRNA RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
21S_rRNA21S_rRNA FAP1P53971 965 aa5.74□□□□□ -1.49
21S_rRNA21S_rRNA LEO1P38439 464 aa5.64□□□□□ -1.51
21S_rRNA21S_rRNA RPL17AP05740 184 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
21S_rRNA21S_rRNA RPL17BP46990 184 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
21S_rRNA21S_rRNA RPG1P38249 964 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
21S_rRNA21S_rRNA ISW2Q08773 1120 aa5.52□□□□□ -1.53
21S_rRNA21S_rRNA SSP1P38871 571 aa5.49□□□□□ -1.53
21S_rRNA21S_rRNA YAH1Q12184 172 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
21S_rRNA21S_rRNA REB1P21538 810 aa5.44□□□□□ -1.54
21S_rRNA21S_rRNA RIM101P33400 625 aa5.42□□□□□ -1.54
21S_rRNA21S_rRNA PRY3P47033 881 aa5.42□□□□□ -1.54
21S_rRNA21S_rRNA DMA2P53924 522 aa5.4□□□□□ -1.54
21S_rRNA21S_rRNA SPT21P35209 758 aa5.39□□□□□ -1.55
21S_rRNA21S_rRNA LEU3P08638 886 aa5.38□□□□□ -1.55
21S_rRNA21S_rRNA OXP1P28273 1286 aa5.37□□□□□ -1.55
21S_rRNA21S_rRNA SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
21S_rRNA21S_rRNA YLR271WQ06152 274 aa5.31□□□□□ -1.56
21S_rRNA21S_rRNA ABP1P15891 592 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
21S_rRNA21S_rRNA PRI1P10363 409 aa5.27□□□□□ -1.57
21S_rRNA21S_rRNA ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data5.27□□□□□ -1.57not detected
21S_rRNA21S_rRNA YIL055CP40523 627 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
21S_rRNA21S_rRNA CST9Q06032 482 aa5.24□□□□□ -1.57
21S_rRNA21S_rRNA RPN1P38764 993 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
21S_rRNA21S_rRNA MGA2P40578 1113 aa5.19□□□□□ -1.58
21S_rRNA21S_rRNA TSR3Q12094 313 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
21S_rRNA21S_rRNA SPB4P25808 606 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
21S_rRNA21S_rRNA RSM7P47150 247 aa5.14□□□□□ -1.59
21S_rRNA21S_rRNA YKR023WP36119 530 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
21S_rRNA21S_rRNA RLF2Q12495 606 aa5.12□□□□□ -1.59
21S_rRNA21S_rRNA VPS70P47161 811 aa5.11□□□□□ -1.59
21S_rRNA21S_rRNA AAD16Q02895 342 aa5.11□□□□□ -1.59
21S_rRNA21S_rRNA DCD1P06773 312 aa5.1□□□□□ -1.59
21S_rRNA21S_rRNA HOP09932 586 aa5.1□□□□□ -1.59
21S_rRNA21S_rRNA RAM2P29703 316 aa5.07□□□□□ -1.6
21S_rRNA21S_rRNA SET1P38827 1080 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
21S_rRNA21S_rRNA CKB1P43639 278 aa5.05□□□□□ -1.6
21S_rRNA21S_rRNA PSD2P53037 1138 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
21S_rRNA21S_rRNA RCR1P38212 213 aa5.03□□□□□ -1.6
21S_rRNA21S_rRNA AI2P03876 854 aa5.02□□□□□ -1.61
21S_rRNA21S_rRNA KIN1P13185 1064 aa5□□□□□ -1.61
21S_rRNA21S_rRNA TFC8Q12308 588 aa4.99□□□□□ -1.61
21S_rRNA21S_rRNA GLC3P32775 704 aa4.98□□□□□ -1.61
21S_rRNA21S_rRNA IFH1P39520 1085 aa4.97□□□□□ -1.61
21S_rRNA21S_rRNA YPR148CQ06523 435 aa4.95□□□□□ -1.62
21S_rRNA21S_rRNA HAA1Q12753 694 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
21S_rRNA21S_rRNA MRM1P25270 412 aa4.94□□□□□ -1.62
21S_rRNA21S_rRNA PBS2P08018 668 aa4.94□□□□□ -1.62
21S_rRNA21S_rRNA GUA1P38625 525 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
21S_rRNA21S_rRNA DSF2P38213 736 aa4.92□□□□□ -1.62
21S_rRNA21S_rRNA DIT2P21595 489 aa4.91□□□□□ -1.62
21S_rRNA21S_rRNA BCH2P36122 765 aa4.91□□□□□ -1.62
21S_rRNA21S_rRNA YML020WQ03722 664 aa4.91□□□□□ -1.62
21S_rRNA21S_rRNA CDC27P38042 758 aa4.9□□□□□ -1.62
21S_rRNA21S_rRNA IES2P40154 320 aa4.89□□□□□ -1.63
21S_rRNA21S_rRNA YNR021WP53723 404 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
21S_rRNA21S_rRNA BBC1P47068 1157 aa4.87□□□□□ -1.63
21S_rRNA21S_rRNA MAM3Q12296 706 aa4.85□□□□□ -1.63
21S_rRNA21S_rRNA MRPL32P25348 183 aa4.84□□□□□ -1.63
21S_rRNA21S_rRNA NUP42P49686 430 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
21S_rRNA21S_rRNA EPS1P40557 701 aa4.84□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA PKC1P24583 1151 aa4.83□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA TFB3Q03290 321 aa4.83□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA MAK11P20484 414 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA COQ8P27697 501 aa4.82□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA SLX8P40072 274 aa4.82□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA RTG3P38165 486 aa4.82□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA AIM7Q12156 149 aa4.81□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA ATF2P53296 535 aa4.8□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA BDF1P35817 686 aa4.8□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA HGH1P48362 394 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA SUB2Q07478 446 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA MIF2P35201 549 aa4.79□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA IOC4Q04213 475 aa4.79□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA REF2P42073 533 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA NOP8Q08287 484 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
21S_rRNA21S_rRNA EDS1P38073 919 aa4.77□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA VPS29P38759 282 aa4.77□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA YJL007CP47080 104 aa4.77□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA ORC1P54784 914 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA SSA1P10591 642 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA GEF1P37020 779 aa4.76□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA BIM1P40013 344 aa4.75□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA ERG12P07277 443 aa4.75□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA ATG32P40458 529 aa4.75□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA YFR006WP43590 535 aa4.74□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA GLN1P32288 370 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA HPC2Q01448 625 aa4.73□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA AIM44Q99299 758 aa4.72□□□□□ -1.65
21S_rRNA21S_rRNA STS1P38637 319 aa4.71□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 91.4 ms