Protein–RNA interactions for Protein: P47053

YJL043W, Uncharacterized protein YJL043W, yeastyeast

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL043WP47053 MMS22YLR320W 4365 nt2.28□□□□□ -2.04
YJL043WP47053 YCK3YER123W 1575 nt2.27□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YLR294CYLR294C 330 nt2.27□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 NAB6YML117W 3405 nt2.27□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 SPO22YIL073C 2928 nt2.27□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 SMC6YLR383W 3345 nt2.27□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 UTP14YML093W 2700 nt2.26□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 VPS16YPL045W 2397 nt2.26□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 ACB1YGR037C 264 nt2.26□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.26□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt2.26□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YNL198CYNL198C 303 nt2.26□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YOR333CYOR333C 417 nt2.26□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YBR277CYBR277C 402 nt2.26□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 RRP12YPL012W 3687 nt2.26□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 SNU114YKL173W 3027 nt2.25□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 PAM16YJL104W 450 nt2.25□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 PCC1YKR095W-A 267 nt2.25□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YBR224WYBR224W 516 nt2.25□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YCL023CYCL023C 348 nt2.25□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YEF3YLR249W 3135 nt2.25□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 HDA3YPR179C 1968 nt2.25□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 SOK2YMR016C 2358 nt2.24□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 PEX8YGR077C 1770 nt2.24□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 MVP1YMR004W 1536 nt2.24□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YLR255CYLR255C 354 nt2.24□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YLR149CYLR149C 2193 nt2.24□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 GEA1YJR031C 4227 nt2.24□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 SCD5YOR329C 2619 nt2.24□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 INP51YIL002C 2841 nt2.24□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 SEF1YBL066C 3447 nt2.24□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 SCW11YGL028C 1629 nt2.24□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 INP53YOR109W 3324 nt2.24□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 PDR11YIL013C 4236 nt2.23□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 CBF2YGR140W 2871 nt2.23□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 STB4YMR019W 2850 nt2.23□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.23□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 TAE2YPL009C 3117 nt2.23□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YBT1YLL048C 4986 nt2.23□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 SIR3YLR442C 2937 nt2.22□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 UPS1YLR193C 528 nt2.22□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 IRR1YIL026C 3453 nt2.22□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 CDC27YBL084C 2277 nt2.22□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 RIC1YLR039C 3171 nt2.22□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 NOP53YPL146C 1368 nt2.22□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 NPR2YEL062W 1848 nt2.21□□□□□ -2.05
YJL043WP47053 YEL043WYEL043W 2871 nt2.21□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 snR55snR55 98 nt2.21□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 snR60snR60 104 nt2.21□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YDR426CYDR426C 378 nt2.21□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YGR250CYGR250C 2346 nt2.21□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 TRX1YLR043C 312 nt2.21□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 PEP3YLR148W 2757 nt2.21□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 IES4YOR189W 351 nt2.21□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YBR184WYBR184W 1572 nt2.21□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 KAP123YER110C 3342 nt2.21□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 PHO2YDL106C 1680 nt2.21□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 ISW1YBR245C 3390 nt2.21□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 VPS34YLR240W 2628 nt2.2□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 PSD2YGR170W 3417 nt2.2□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 SNC1YAL030W 354 nt2.2□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 CYB5YNL111C 363 nt2.2□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.2□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 AFI1YOR129C 2682 nt2.2□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 VTC3YPL019C 2508 nt2.2□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 PXA2YKL188C 2562 nt2.19□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 GPG1YGL121C 381 nt2.19□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YGR050CYGR050C 357 nt2.19□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt2.19□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YKU80YMR106C 1890 nt2.19□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 CRM1YGR218W 3255 nt2.19□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 CDC53YDL132W 2448 nt2.19□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 SMY1YKL079W 1971 nt2.18□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.18□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.18□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YNL114CYNL114C 372 nt2.18□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 HSC82YMR186W 2118 nt2.18□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 LCD1YDR499W 2244 nt2.18□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 SMY2YBR172C 2223 nt2.18□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 EFR3YMR212C 2349 nt2.18□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 SCP160YJL080C 3669 nt2.18□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YOL098CYOL098C 3114 nt2.17□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 SCH9YHR205W 2475 nt2.17□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 VPH1YOR270C 2523 nt2.17□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 INO80YGL150C 4470 nt2.17□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 ISD11YER048W-A 285 nt2.17□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YNL028WYNL028W 318 nt2.17□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 GRR1YJR090C 3456 nt2.16□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt2.16□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YGL052WYGL052W 306 nt2.16□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YJL182CYJL182C 318 nt2.16□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt2.16□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 YOR302WYOR302W 78 nt2.16□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 SWR1YDR334W 4545 nt2.16□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 PLC1YPL268W 2610 nt2.16□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 TOF1YNL273W 3717 nt2.16□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 RRP6YOR001W 2202 nt2.15□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 HOS4YIL112W 3252 nt2.15□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 MGM1YOR211C 2646 nt2.15□□□□□ -2.06
YJL043WP47053 TOP2YNL088W 4287 nt2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 51 ms