Protein–RNA interactions for Protein: P47053

YJL043W, Uncharacterized protein YJL043W, yeastyeast

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL043WP47053 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.29■□□□□ 0.68
YJL043WP47053 NSR1YGR159C 1245 nt19.26■□□□□ 0.67
YJL043WP47053 NOP1YDL014W 984 nt18.62■□□□□ 0.57
YJL043WP47053 MDJ1YFL016C 1536 nt17.35■□□□□ 0.37
YJL043WP47053 YKL036CYKL036C 393 nt17.02■□□□□ 0.32
YJL043WP47053 SRX1YKL086W 384 nt16.27■□□□□ 0.2
YJL043WP47053 Q0297Q0297 156 nt16.24■□□□□ 0.19
YJL043WP47053 YJL027CYJL027C 417 nt15.97■□□□□ 0.15
YJL043WP47053 YCR051WYCR051W 669 nt15.45■□□□□ 0.06
YJL043WP47053 SCS3YGL126W 1143 nt15.45■□□□□ 0.06
YJL043WP47053 DBP2YNL112W 1641 nt15.25■□□□□ 0.03
YJL043WP47053 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.85□□□□□ -0.03
YJL043WP47053 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.85□□□□□ -0.03
YJL043WP47053 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.85□□□□□ -0.03
YJL043WP47053 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.85□□□□□ -0.03
YJL043WP47053 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.85□□□□□ -0.03
YJL043WP47053 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.85□□□□□ -0.03
YJL043WP47053 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.85□□□□□ -0.03
YJL043WP47053 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.85□□□□□ -0.03
YJL043WP47053 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.85□□□□□ -0.03
YJL043WP47053 YBR190WYBR190W 312 nt14.79□□□□□ -0.04
YJL043WP47053 YOL085CYOL085C 342 nt14.75□□□□□ -0.05
YJL043WP47053 CCC1YLR220W 969 nt14.71□□□□□ -0.05
YJL043WP47053 RPP1BYDL130W 321 nt14.58□□□□□ -0.08
YJL043WP47053 PKP1YIL042C 1185 nt14.58□□□□□ -0.08
YJL043WP47053 RTC3YHR087W 336 nt14.48□□□□□ -0.09
YJL043WP47053 RVS167YDR388W 1449 nt14.3□□□□□ -0.12
YJL043WP47053 SCJ1YMR214W 1134 nt14.22□□□□□ -0.13
YJL043WP47053 PET122YER153C 765 nt13.98□□□□□ -0.17
YJL043WP47053 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.98□□□□□ -0.17
YJL043WP47053 ATS1YAL020C 1002 nt13.84□□□□□ -0.19
YJL043WP47053 SSA3YBL075C 1950 nt13.8□□□□□ -0.2
YJL043WP47053 SCR1SCR1 522 nt13.76□□□□□ -0.21
YJL043WP47053 SHR5YOL110W 714 nt13.75□□□□□ -0.21
YJL043WP47053 PUT4YOR348C 1884 nt13.59□□□□□ -0.23
YJL043WP47053 RRN5YLR141W 1092 nt13.53□□□□□ -0.24
YJL043WP47053 YDJ1YNL064C 1230 nt13.5□□□□□ -0.25
YJL043WP47053 URN1YPR152C 1398 nt13.49□□□□□ -0.25
YJL043WP47053 DEP1YAL013W 1218 nt13.45□□□□□ -0.26
YJL043WP47053 OPI9YLR338W 858 nt13.31□□□□□ -0.28
YJL043WP47053 SAH1YER043C 1350 nt13.3□□□□□ -0.28
YJL043WP47053 ARE1YCR048W 1833 nt13.29□□□□□ -0.28
YJL043WP47053 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.27□□□□□ -0.29
YJL043WP47053 GAR1YHR089C 618 nt13.27□□□□□ -0.29
YJL043WP47053 RPN10YHR200W 807 nt13.23□□□□□ -0.29
YJL043WP47053 RSB1YOR049C 1065 nt13.22□□□□□ -0.29
YJL043WP47053 YNL208WYNL208W 600 nt13.19□□□□□ -0.3
YJL043WP47053 POA1YBR022W 534 nt13.16□□□□□ -0.3
YJL043WP47053 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.15□□□□□ -0.3
YJL043WP47053 PUN1YLR414C 792 nt12.93□□□□□ -0.34
YJL043WP47053 BSC6YOL137W 1494 nt12.91□□□□□ -0.34
YJL043WP47053 YJR018WYJR018W 363 nt12.84□□□□□ -0.35
YJL043WP47053 BUD23YCR047C 828 nt12.83□□□□□ -0.36
YJL043WP47053 TIR1YER011W 765 nt12.82□□□□□ -0.36
YJL043WP47053 PTC2YER089C 1395 nt12.81□□□□□ -0.36
YJL043WP47053 PST2YDR032C 597 nt12.81□□□□□ -0.36
YJL043WP47053 SSA1YAL005C 1929 nt12.71□□□□□ -0.37
YJL043WP47053 NAB2YGL122C 1578 nt12.66□□□□□ -0.38
YJL043WP47053 YJR120WYJR120W 351 nt12.63□□□□□ -0.39
YJL043WP47053 RPP2BYDR382W 333 nt12.54□□□□□ -0.4
YJL043WP47053 FIS1YIL065C 468 nt12.5□□□□□ -0.41
YJL043WP47053 SRB2YHR041C 633 nt12.48□□□□□ -0.41
YJL043WP47053 DAL1YIR027C 1383 nt12.47□□□□□ -0.41
YJL043WP47053 FPR4YLR449W 1179 nt12.46□□□□□ -0.41
YJL043WP47053 SPT5YML010W 3192 nt12.4□□□□□ -0.42
YJL043WP47053 INM2YDR287W 879 nt12.38□□□□□ -0.43
YJL043WP47053 PHO4YFR034C 939 nt12.37□□□□□ -0.43
YJL043WP47053 YKL097CYKL097C 411 nt12.34□□□□□ -0.43
YJL043WP47053 SHU1YHL006C 453 nt12.29□□□□□ -0.44
YJL043WP47053 YBL100CYBL100C 315 nt12.28□□□□□ -0.44
YJL043WP47053 BDH2YAL061W 1254 nt12.25□□□□□ -0.45
YJL043WP47053 WWM1YFL010C 636 nt12.24□□□□□ -0.45
YJL043WP47053 YPS1YLR120C 1710 nt12.17□□□□□ -0.46
YJL043WP47053 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.15□□□□□ -0.46
YJL043WP47053 MEP2YNL142W 1500 nt12.12□□□□□ -0.47
YJL043WP47053 FUN26YAL022C 1554 nt12.12□□□□□ -0.47
YJL043WP47053 YGR021WYGR021W 873 nt12.09□□□□□ -0.47
YJL043WP47053 YDR095CYDR095C 411 nt12.07□□□□□ -0.48
YJL043WP47053 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.07□□□□□ -0.48
YJL043WP47053 SSA4YER103W 1929 nt12.06□□□□□ -0.48
YJL043WP47053 HOM6YJR139C 1080 nt12.04□□□□□ -0.48
YJL043WP47053 TRM9YML014W 840 nt12.04□□□□□ -0.48
YJL043WP47053 LSM3YLR438C-A 270 nt12.03□□□□□ -0.48
YJL043WP47053 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.02□□□□□ -0.49
YJL043WP47053 MNP1YGL068W 585 nt12.01□□□□□ -0.49
YJL043WP47053 ALF1YNL148C 765 nt11.99□□□□□ -0.49
YJL043WP47053 DCW1YKL046C 1350 nt11.95□□□□□ -0.5
YJL043WP47053 CCT6YDR188W 1641 nt11.94□□□□□ -0.5
YJL043WP47053 YOR139CYOR139C 393 nt11.88□□□□□ -0.51
YJL043WP47053 RKM5YLR137W 1104 nt11.87□□□□□ -0.51
YJL043WP47053 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.85□□□□□ -0.51
YJL043WP47053 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.85□□□□□ -0.51
YJL043WP47053 RPP2AYOL039W 321 nt11.84□□□□□ -0.51
YJL043WP47053 PTP1YDL230W 1008 nt11.81□□□□□ -0.52
YJL043WP47053 SIS1YNL007C 1059 nt11.79□□□□□ -0.52
YJL043WP47053 EMI2YDR516C 1503 nt11.79□□□□□ -0.52
YJL043WP47053 CAC2YML102W 1407 nt11.76□□□□□ -0.53
YJL043WP47053 YDL221WYDL221W 552 nt11.69□□□□□ -0.54
YJL043WP47053 NPL3YDR432W 1245 nt11.69□□□□□ -0.54
YJL043WP47053 YMR090WYMR090W 684 nt11.69□□□□□ -0.54
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