Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD0

WASHC2D, WASH complex subunit 2D, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC2DQ5SRD0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
WASHC2DQ5SRD0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.8 ms