Protein–RNA interactions for Protein: Q12745

SEC39, Protein transport protein SEC39, yeastyeast

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC39Q12745 LSO2YGR169C-A 279 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 ATP7YKL016C 525 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 YLR101CYLR101C 396 nt2.21□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 DIS3YOL021C 3006 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 TOR2YKL203C 7425 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 CLN3YAL040C 1743 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 GDS1YOR355W 1569 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 snR13snR13 124 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 RTC6YPL183W-A 282 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 MET18YIL128W 3099 nt2.2□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 snR79snR79 84 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 YER068C-AYER068C-A 432 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 TIF11YMR260C 462 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 CMC2YBL059C-A 330 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 CDC33YOL139C 642 nt2.19□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 ATP17YDR377W 306 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 YER006C-AYER006C-A 318 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 HUR1YGL168W 333 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 YGR042WYGR042W 816 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 SEC22YLR268W 645 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 YNL324WYNL324W 396 nt2.18□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 RTT107YHR154W 3213 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 BUD2YKL092C 3315 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 MSL1YIR009W 336 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 EGD1YPL037C 474 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 SWT1YOR166C 1377 nt2.17□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 SEC31YDL195W 3822 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 RPS22BYLR367W 393 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 SPO22YIL073C 2928 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 VPS35YJL154C 2835 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 KAR3YPR141C 2190 nt2.16□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 BRE1YDL074C 2103 nt2.15□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 SOK2YMR016C 2358 nt2.15□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 RUD3YOR216C 1455 nt2.15□□□□□ -2.06
SEC39Q12745 NIC96YFR002W 2520 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 CDC53YDL132W 2448 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YKL063CYKL063C 504 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YBR032WYBR032W 303 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 SNC2YOR327C 348 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 MSS18YPR134W 807 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YPR177CYPR177C 372 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 COX1Q0045 1605 nt2.15□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 CRG1YHR209W 876 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YOR333CYOR333C 417 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 PRM3YPL192C 402 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 SAP190YKR028W 3102 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 VMR1YHL035C 4779 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 MGA2YIR033W 3342 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 MSS11YMR164C 2277 nt2.14□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 CDC24YAL041W 2565 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YSW1YBR148W 1830 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 RPS24AYER074W 408 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YKL202WYKL202W 582 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 RRT1YBL048W 312 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.13□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 ATG9YDL149W 2994 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YER121WYER121W 345 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YER135CYER135C 393 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 GCN2YDR283C 4980 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 CRM1YGR218W 3255 nt2.12□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 SPC72YAL047C 1869 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 COS111YBR203W 2775 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YMR045CYMR045C 5268 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YDR114CYDR114C 303 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 HOP2YGL033W 657 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YPR146CYPR146C 330 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 VPH1YOR270C 2523 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 SGD1YLR336C 2700 nt2.11□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 CHC1YGL206C 4962 nt2.1□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 FKS1YLR342W 5631 nt2.1□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YFL019CYFL019C 354 nt2.1□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 RPS18BYML026C 441 nt2.1□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 ZEO1YOL109W 342 nt2.1□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 FYV12YOR183W 390 nt2.1□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 MNE1YOR350C 1992 nt2.1□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 TRL1YJL087C 2484 nt2.1□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 RTT101YJL047C 2529 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YGL069CYGL069C 465 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 VPS8YAL002W 3825 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 NFU1YKL040C 771 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.09□□□□□ -2.07
SEC39Q12745 STB4YMR019W 2850 nt2.09□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 RIC1YLR039C 3171 nt2.09□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 NUP120YKL057C 3114 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 CDC27YBL084C 2277 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 PEX8YGR077C 1770 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YDR286CYDR286C 345 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 AGA2YGL032C 264 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 FCF2YLR051C 654 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 GPX2YBR244W 489 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 LRE1YCL051W 1752 nt2.08□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 NOT5YPR072W 1683 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 IES5YER092W 378 nt2.07□□□□□ -2.08
SEC39Q12745 YGL024WYGL024W 336 nt2.07□□□□□ -2.08
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