Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 RIO2YNL207W 1278 nt0.74□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 BRX1YOL077C 876 nt0.74□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 ROX1YPR065W 1107 nt0.74□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 snR34snR34 203 nt0.74□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YBR287WYBR287W 1284 nt0.74□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 SLX4YLR135W 2247 nt0.74□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 IML1YJR138W 4755 nt0.73□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 RAD50YNL250W 3939 nt0.73□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YIR020CYIR020C 303 nt0.73□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 HYM1YKL189W 1200 nt0.73□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 RPS16AYMR143W 432 nt0.73□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YNL235CYNL235C 432 nt0.73□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YPR117WYPR117W 7470 nt0.73□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt0.72□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 RSM28YDR494W 1086 nt0.72□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 PHO80YOL001W 882 nt0.72□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YBR224WYBR224W 516 nt0.72□□□□□ -2.29
PKR1Q03880 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.71□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 LAG1YHL003C 1236 nt0.71□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 YML003WYML003W 873 nt0.71□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 PKR1YMR123W 369 nt0.71□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 ATP15YPL271W 189 nt0.71□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.71□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 YGL204CYGL204C 306 nt0.7□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 PSF2YJL072C 642 nt0.7□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 URA10YMR271C 684 nt0.7□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 KIP1YBL063W 3336 nt0.7□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 YJR098CYJR098C 1971 nt0.7□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 YLL054CYLL054C 2532 nt0.7□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 SLU7YDR088C 1149 nt0.69□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 PEP8YJL053W 1140 nt0.69□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.69□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 YCS4YLR272C 3531 nt0.69□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 IRR1YIL026C 3453 nt0.69□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 DOP1YDR141C 5097 nt0.68□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 BTN2YGR142W 1233 nt0.68□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 BET4YJL031C 984 nt0.68□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 RCN1YKL159C 636 nt0.68□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 PEP3YLR148W 2757 nt0.68□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 SWS2YNL081C 432 nt0.68□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 APL3YBL037W 3078 nt0.68□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 SGO1YOR073W 1773 nt0.68□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 SEC1YDR164C 2175 nt0.67□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 RAD6YGL058W 519 nt0.67□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 THG1YGR024C 714 nt0.67□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 YAP3YHL009C 993 nt0.67□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 CLU1YMR012W 3834 nt0.67□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 ATG16YMR159C 453 nt0.67□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 HCH1YNL281W 462 nt0.67□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 OST2YOR103C 393 nt0.67□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 YOR366WYOR366W 354 nt0.67□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 PAU24YBR301W 363 nt0.67□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 SLS1YLR139C 1932 nt0.67□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 SPT21YMR179W 2277 nt0.66□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 RPL9BYNL067W 576 nt0.66□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 IRC14YOR135C 342 nt0.66□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 FMP23YBR047W 528 nt0.66□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 snR44snR44 211 nt0.66□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 AIM9YER080W 1884 nt0.66□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 DPB11YJL090C 2295 nt0.66□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 KAR9YPL269W 1935 nt0.66□□□□□ -2.3
PKR1Q03880 PIP2YOR363C 2991 nt0.65□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 NTF2YER009W 378 nt0.65□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 VMA7YGR020C 357 nt0.65□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YGR265WYGR265W 411 nt0.65□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 HTD2YHR067W 843 nt0.65□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 LCL2YLR104W 396 nt0.65□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.65□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.65□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 GDS1YOR355W 1569 nt0.65□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 NUP145YGL092W 3954 nt0.64□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YDR250CYDR250C 276 nt0.64□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 DDR48YMR173W 1293 nt0.64□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 PAI3YMR174C 207 nt0.64□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 RPL29YFR032C-A 180 nt0.63□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 SVP26YHR181W 687 nt0.63□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.63□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YLR302CYLR302C 363 nt0.63□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 SHE4YOR035C 2370 nt0.62□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 NUP120YKL057C 3114 nt0.62□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 RTR2YDR066C 591 nt0.62□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 ATC1YDR184C 885 nt0.62□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YGL042CYGL042C 306 nt0.62□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 PRM8YGL053W 714 nt0.62□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 NBL1YHR199C-A 222 nt0.62□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YMR324CYMR324C 243 nt0.62□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YPL039WYPL039W 951 nt0.62□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 DCP2YNL118C 2913 nt0.62□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 UTP13YLR222C 2454 nt0.62□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 SGD1YLR336C 2700 nt0.61□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 CYC7YEL039C 342 nt0.61□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 RSM18YER050C 417 nt0.61□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YJL086CYJL086C 369 nt0.61□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 SEC22YLR268W 645 nt0.61□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YBL073WYBL073W 312 nt0.61□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 SWT1YOR166C 1377 nt0.6□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 PAU2YEL049W 363 nt0.6□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YER121WYER121W 345 nt0.6□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.6□□□□□ -2.31
PKR1Q03880 YCL046WYCL046W 324 nt0.6□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 8.8 ms