RNA–Protein interactions for RNA: YER009W

NTF2, Transcript of Nuclear envelope protein, yeastyeast

Gene NTF2, Length 378 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTF2YER009W MTC1P47018 478 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
NTF2YER009W FAP1P53971 965 aa10.69□□□□□ -0.7
NTF2YER009W DRS1P32892 752 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
NTF2YER009W PRY3P47033 881 aa10.07□□□□□ -0.8
NTF2YER009W AAD16Q02895 342 aa9.63□□□□□ -0.87
NTF2YER009W PRI1P10363 409 aa9.56□□□□□ -0.88
NTF2YER009W YCK3P39962 524 aa9.45□□□□□ -0.9
NTF2YER009W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
NTF2YER009W ISW2Q08773 1120 aa9.1□□□□□ -0.95
NTF2YER009W BFR2Q06631 534 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
NTF2YER009W RPG1P38249 964 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
NTF2YER009W TSR3Q12094 313 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
NTF2YER009W DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
NTF2YER009W AVT3P36062 692 aa8.79□□□□□ -1
NTF2YER009W MRPL32P25348 183 aa8.66□□□□□ -1.02
NTF2YER009W YGL015CP33199 130 aa8.6□□□□□ -1.03
NTF2YER009W TFA1P36100 482 aa8.46□□□□□ -1.06
NTF2YER009W RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
NTF2YER009W BUD31P25337 157 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
NTF2YER009W RPL17AP05740 184 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
NTF2YER009W REB1P21538 810 aa8.12□□□□□ -1.11
NTF2YER009W RPL17BP46990 184 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
NTF2YER009W CDC27P38042 758 aa8□□□□□ -1.13
NTF2YER009W UBP10P53874 792 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
NTF2YER009W MAP2P38174 421 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
NTF2YER009W SPT21P35209 758 aa7.81□□□□□ -1.16
NTF2YER009W SIS1P25294 352 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
NTF2YER009W YKR023WP36119 530 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
NTF2YER009W UBP9P39967 754 aa7.71□□□□□ -1.18
NTF2YER009W RIM101P33400 625 aa7.7□□□□□ -1.18
NTF2YER009W TIF4632P39936 914 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
NTF2YER009W TGL3P40308 642 aa7.64□□□□□ -1.19
NTF2YER009W TFC8Q12308 588 aa7.62□□□□□ -1.19
NTF2YER009W HOP09932 586 aa7.59□□□□□ -1.19
NTF2YER009W DCD1P06773 312 aa7.56□□□□□ -1.2
NTF2YER009W SCY1P53009 804 aa7.55□□□□□ -1.2
NTF2YER009W SLX5P32828 619 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
NTF2YER009W OXP1P28273 1286 aa7.46□□□□□ -1.22
NTF2YER009W PTP3P40048 928 aa7.41□□□□□ -1.22
NTF2YER009W YIL055CP40523 627 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
NTF2YER009W SSP1P38871 571 aa7.34□□□□□ -1.23
NTF2YER009W YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
NTF2YER009W BCH2P36122 765 aa7.33□□□□□ -1.24
NTF2YER009W RSM7P47150 247 aa7.24□□□□□ -1.25
NTF2YER009W YLR271WQ06152 274 aa7.24□□□□□ -1.25
NTF2YER009W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.22□□□□□ -1.25not detected
NTF2YER009W MST1P07236 462 aa7.21□□□□□ -1.26
NTF2YER009W YBL029C-AQ3E756 94 aa7.19□□□□□ -1.26
NTF2YER009W AI2P03876 854 aa7.12□□□□□ -1.27
NTF2YER009W YOR238WQ08634 303 aa7.12□□□□□ -1.27
NTF2YER009W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
NTF2YER009W VNX1P42839 908 aa7.1□□□□□ -1.27
NTF2YER009W BDF1P35817 686 aa7.08□□□□□ -1.28
NTF2YER009W EPS1P40557 701 aa7.08□□□□□ -1.28
NTF2YER009W MGA2P40578 1113 aa7.08□□□□□ -1.28
NTF2YER009W BBC1P47068 1157 aa7.07□□□□□ -1.28
NTF2YER009W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
NTF2YER009W SPP1Q03012 353 aa7.04□□□□□ -1.28
NTF2YER009W NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data7.02□□□□□ -1.29not detected
NTF2YER009W CST9Q06032 482 aa7.02□□□□□ -1.29
NTF2YER009W YJL171CP46992 396 aa7□□□□□ -1.29
NTF2YER009W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
NTF2YER009W DMA1P38823 416 aa6.96□□□□□ -1.3
NTF2YER009W YAP5P40574 245 aa6.94□□□□□ -1.3
NTF2YER009W FKH1P40466 484 aa6.93□□□□□ -1.3
NTF2YER009W WSC3Q12215 556 aa6.93□□□□□ -1.3
NTF2YER009W TIF11P38912 153 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
NTF2YER009W MRM1P25270 412 aa6.9□□□□□ -1.3
NTF2YER009W BMT6Q12291 365 aa6.82□□□□□ -1.32
NTF2YER009W RTG3P38165 486 aa6.81□□□□□ -1.32
NTF2YER009W GTT3P39996 337 aa6.81□□□□□ -1.32
NTF2YER009W RCR1P38212 213 aa6.79□□□□□ -1.32
NTF2YER009W LDB19Q12502 818 aa6.79□□□□□ -1.32
NTF2YER009W RAM2P29703 316 aa6.76□□□□□ -1.33
NTF2YER009W ULI1P43604 169 aa6.76□□□□□ -1.33
NTF2YER009W IOC2Q12072 812 aa6.75□□□□□ -1.33
NTF2YER009W VPS29P38759 282 aa6.73□□□□□ -1.33
NTF2YER009W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data6.68□□□□□ -1.34not detected
NTF2YER009W MAK11P20484 414 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
NTF2YER009W EAP1P36041 632 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
NTF2YER009W DBP1P24784 617 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
NTF2YER009W STS1P38637 319 aa6.63□□□□□ -1.35
NTF2YER009W MSB4Q12317 492 aa6.63□□□□□ -1.35
NTF2YER009W YFR006WP43590 535 aa6.62□□□□□ -1.35
NTF2YER009W SET1P38827 1080 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
NTF2YER009W PIB1Q06651 286 aa6.6□□□□□ -1.35
NTF2YER009W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NTF2YER009W NCR1Q12200 1170 aa6.6□□□□□ -1.35
NTF2YER009W RTG1P32607 177 aa6.59□□□□□ -1.35
NTF2YER009W COQ8P27697 501 aa6.56□□□□□ -1.36
NTF2YER009W MIF2P35201 549 aa6.54□□□□□ -1.36
NTF2YER009W TRP5P00931 707 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
NTF2YER009W SEC61P32915 480 aa6.53□□□□□ -1.36
NTF2YER009W EDS1P38073 919 aa6.52□□□□□ -1.37
NTF2YER009W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
NTF2YER009W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
NTF2YER009W IFH1P39520 1085 aa6.5□□□□□ -1.37
NTF2YER009W YPR148CQ06523 435 aa6.5□□□□□ -1.37
NTF2YER009W YOL036WQ08206 761 aa6.5□□□□□ -1.37
NTF2YER009W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
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