Protein–RNA interactions for Protein: P38842

YHR140W, UPF0641 membrane protein YHR140W, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WP38842 TIM18YOR297C 579 nt0.7□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 snR14snR14 160 nt0.7□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 YPL039WYPL039W 951 nt0.7□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 GPX2YBR244W 489 nt0.7□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 BUD3YCL014W 4911 nt0.7□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.7□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 SHS1YDL225W 1656 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 DOP1YDR141C 5097 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 SLU7YDR088C 1149 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 YLR302CYLR302C 363 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 YOR169CYOR169C 465 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 IRR1YIL026C 3453 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 YLL054CYLL054C 2532 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 NOT5YPR072W 1683 nt0.69□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 YDR261W-AYDR261W-A 1317 nt0.68□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 RSM28YDR494W 1086 nt0.68□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 ABM1YJR108W 372 nt0.68□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 RPL40BYKR094C 387 nt0.68□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 YNL235CYNL235C 432 nt0.68□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 OST2YOR103C 393 nt0.68□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 PAU24YBR301W 363 nt0.68□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 SWI4YER111C 3282 nt0.68□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 YCS4YLR272C 3531 nt0.67□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 RUB1YDR139C 234 nt0.67□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 RTR1YER139C 681 nt0.67□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 PRM8YGL053W 714 nt0.67□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 LAG1YHL003C 1236 nt0.67□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 LCL2YLR104W 396 nt0.67□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 RIO2YNL207W 1278 nt0.67□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 YOR366WYOR366W 354 nt0.67□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 RTC6YPL183W-A 282 nt0.67□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 NUP120YKL057C 3114 nt0.67□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 RMD6YEL072W 696 nt0.66□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 FMP23YBR047W 528 nt0.66□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 CDC39YCR093W 6327 nt0.66□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 OSH6YKR003W 1347 nt0.65□□□□□ -2.3
YHR140WP38842 ATC1YDR184C 885 nt0.65□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 GEP7YGL057C 864 nt0.65□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YGL217CYGL217C 342 nt0.65□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 CGI121YML036W 546 nt0.65□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 URA10YMR271C 684 nt0.65□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 DIA1YMR316W 1011 nt0.65□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YNL179CYNL179C 438 nt0.65□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 TTI1YKL033W 3117 nt0.65□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 STB6YKL072W 2301 nt0.65□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 RAD50YNL250W 3939 nt0.64□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YER121WYER121W 345 nt0.64□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 RPL22BYFL034C-A 369 nt0.64□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 SVP26YHR181W 687 nt0.64□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YIR020CYIR020C 303 nt0.64□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 PEP8YJL053W 1140 nt0.64□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 GPX1YKL026C 504 nt0.64□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.64□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 HYM1YKL189W 1200 nt0.64□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 IRC23YOR044W 474 nt0.64□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YOR105WYOR105W 327 nt0.64□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 SLX4YLR135W 2247 nt0.64□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YDR248CYDR248C 582 nt0.63□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 NTF2YER009W 378 nt0.63□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 RAD6YGL058W 519 nt0.63□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 THG1YGR024C 714 nt0.63□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 NBL1YHR199C-A 222 nt0.63□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YPR117WYPR117W 7470 nt0.63□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 NUP145YGL092W 3954 nt0.63□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 SGO1YOR073W 1773 nt0.62□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 KAR9YPL269W 1935 nt0.62□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YGL042CYGL042C 306 nt0.62□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 VMA7YGR020C 357 nt0.62□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YAP3YHL009C 993 nt0.62□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 LSM12YHR121W 564 nt0.62□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.62□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 RPL9BYNL067W 576 nt0.62□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 SWS2YNL081C 432 nt0.62□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 PHO80YOL001W 882 nt0.62□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 ROX1YPR065W 1107 nt0.62□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YBR224WYBR224W 516 nt0.62□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 VPS74YDR372C 1038 nt0.61□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 OST5YGL226C-A 261 nt0.61□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 BET4YJL031C 984 nt0.61□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YMR324CYMR324C 243 nt0.61□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.6□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 DCP2YNL118C 2913 nt0.6□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 RTR2YDR066C 591 nt0.6□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 LSO2YGR169C-A 279 nt0.6□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 PAI3YMR174C 207 nt0.6□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 BRX1YOL077C 876 nt0.6□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 PEP3YLR148W 2757 nt0.6□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 SPT21YMR179W 2277 nt0.59□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 SEC1YDR164C 2175 nt0.59□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YGR265WYGR265W 411 nt0.59□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 RPS30AYLR287C-A 192 nt0.59□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt0.59□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 RPS7BYNL096C 573 nt0.59□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 YBL073WYBL073W 312 nt0.59□□□□□ -2.31
YHR140WP38842 CDC24YAL041W 2565 nt0.59□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 PIP2YOR363C 2991 nt0.59□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 RSM23YGL129C 1353 nt0.58□□□□□ -2.32
YHR140WP38842 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.1 ms