Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 COX1Q0045 1605 nt2.28□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 SWR1YDR334W 4545 nt2.28□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 UFD4YKL010C 4452 nt2.28□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YPR097WYPR097W 3222 nt2.28□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 snR79snR79 84 nt2.28□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.28□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt2.28□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt2.28□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 GRX8YLR364W 330 nt2.28□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 YPL261CYPL261C 309 nt2.28□□□□□ -2.04
YBL055CP34220 UTP22YGR090W 3714 nt2.27□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 SEC16YPL085W 6588 nt2.27□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 MSL5YLR116W 1431 nt2.27□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 RPL27BYDR471W 411 nt2.27□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 SDH7YDR511W 402 nt2.27□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 GCN4YEL009C 846 nt2.27□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 YOR053WYOR053W 342 nt2.27□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 MKT1YNL085W 2493 nt2.27□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 YFR016CYFR016C 3702 nt2.27□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 NUP170YBL079W 4509 nt2.27□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 MCD1YDL003W 1701 nt2.26□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 UTP30YKR060W 825 nt2.26□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 GIS1YDR096W 2685 nt2.25□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 BFA1YJR053W 1725 nt2.25□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 RRP6YOR001W 2202 nt2.25□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 TIM9YEL020W-A 264 nt2.25□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt2.25□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt2.25□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt2.25□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 SEC22YLR268W 645 nt2.25□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 ALK2YBL009W 2031 nt2.25□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 CBS1YDL069C 690 nt2.24□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 GIM4YEL003W 336 nt2.24□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 VTC1YER072W 390 nt2.24□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 LSO2YGR169C-A 279 nt2.24□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 NOP10YHR072W-A 177 nt2.24□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 URM1YIL008W 300 nt2.24□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 YLR287CYLR287C 1068 nt2.24□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 UBC7YMR022W 498 nt2.24□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 DGR1YNL130C-A 147 nt2.24□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 YPL185WYPL185W 396 nt2.24□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 CDC24YAL041W 2565 nt2.24□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 SWT1YOR166C 1377 nt2.23□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 DIE2YGR227W 1578 nt2.23□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 KAR3YPR141C 2190 nt2.23□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 Q0142Q0142 177 nt2.23□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 RPS24BYIL069C 408 nt2.23□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 PAU8YAL068C 363 nt2.23□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 RPS18BYML026C 441 nt2.23□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 MRPL50YNR022C 420 nt2.23□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 PAU20YOL161C 363 nt2.23□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 RTC6YPL183W-A 282 nt2.23□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 BRE1YDL074C 2103 nt2.23□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 SPP41YDR464W 4308 nt2.22□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 CDC50YCR094W 1176 nt2.22□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 RPS24AYER074W 408 nt2.22□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 YER121WYER121W 345 nt2.22□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 SMD1YGR074W 441 nt2.22□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.22□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 SIR4YDR227W 4077 nt2.22□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 IRA2YOL081W 9240 nt2.22□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 TOF1YNL273W 3717 nt2.22□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 DAS1YJL149W 1992 nt2.21□□□□□ -2.05
YBL055CP34220 MMS22YLR320W 4365 nt2.21□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 SOK2YMR016C 2358 nt2.21□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 TMA22YJR014W 597 nt2.21□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 SNC1YAL030W 354 nt2.21□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 YAR047CYAR047C 321 nt2.21□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 YPR146CYPR146C 330 nt2.21□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 UBP2YOR124C 3819 nt2.21□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.2□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 FCF2YLR051C 654 nt2.2□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 YLR434CYLR434C 384 nt2.2□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 BSC3YLR465C 309 nt2.2□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 RPS17AYML024W 411 nt2.2□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.2□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 VPS35YJL154C 2835 nt2.2□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 KAP123YER110C 3342 nt2.2□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 NAB6YML117W 3405 nt2.19□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 AFI1YOR129C 2682 nt2.19□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 MSL1YIR009W 336 nt2.19□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 YBL071CYBL071C 309 nt2.19□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 YOR146WYOR146W 306 nt2.19□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 SNC2YOR327C 348 nt2.19□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 SCH9YHR205W 2475 nt2.18□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 UBR1YGR184C 5853 nt2.18□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 SGD1YLR336C 2700 nt2.18□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 STH1YIL126W 4080 nt2.18□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 NOP14YDL148C 2433 nt2.18□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 NUP120YKL057C 3114 nt2.17□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 ATG31YDR022C 591 nt2.17□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.17□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 YOR029WYOR029W 336 nt2.17□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 GNT1YOR320C 1476 nt2.16□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 BRP1YGL007W 378 nt2.16□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 YGL024WYGL024W 336 nt2.16□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt2.16□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 ATP7YKL016C 525 nt2.16□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 KOG1YHR186C 4674 nt2.16□□□□□ -2.06
YBL055CP34220 CDC53YDL132W 2448 nt2.16□□□□□ -2.06
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