Protein–RNA interactions for Protein: P34220

YBL055C, Deoxyribonuclease Tat-D, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YBL055CP34220 NSR1YGR159C 1245 nt21.34■■□□□ 1.01
YBL055CP34220 YML009W-BYML009W-B 477 nt21.32■■□□□ 1
YBL055CP34220 NOP1YDL014W 984 nt20.61■□□□□ 0.89
YBL055CP34220 MDJ1YFL016C 1536 nt19.17■□□□□ 0.66
YBL055CP34220 YKL036CYKL036C 393 nt18.84■□□□□ 0.61
YBL055CP34220 SRX1YKL086W 384 nt18.02■□□□□ 0.48
YBL055CP34220 Q0297Q0297 156 nt17.99■□□□□ 0.47
YBL055CP34220 YJL027CYJL027C 417 nt17.67■□□□□ 0.42
YBL055CP34220 YCR051WYCR051W 669 nt17.09■□□□□ 0.33
YBL055CP34220 SCS3YGL126W 1143 nt17.04■□□□□ 0.32
YBL055CP34220 DBP2YNL112W 1641 nt16.88■□□□□ 0.29
YBL055CP34220 TRN1tP(UGG)A 72 nt16.42■□□□□ 0.22
YBL055CP34220 SUF9tP(UGG)F 72 nt16.42■□□□□ 0.22
YBL055CP34220 SUF8tP(UGG)H 72 nt16.42■□□□□ 0.22
YBL055CP34220 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt16.42■□□□□ 0.22
YBL055CP34220 SUF7tP(UGG)M 72 nt16.42■□□□□ 0.22
YBL055CP34220 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt16.42■□□□□ 0.22
YBL055CP34220 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt16.42■□□□□ 0.22
YBL055CP34220 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt16.42■□□□□ 0.22
YBL055CP34220 SUF11tP(UGG)O2 72 nt16.42■□□□□ 0.22
YBL055CP34220 YBR190WYBR190W 312 nt16.38■□□□□ 0.21
YBL055CP34220 YOL085CYOL085C 342 nt16.34■□□□□ 0.21
YBL055CP34220 CCC1YLR220W 969 nt16.28■□□□□ 0.2
YBL055CP34220 RPP1BYDL130W 321 nt16.14■□□□□ 0.17
YBL055CP34220 PKP1YIL042C 1185 nt16.13■□□□□ 0.17
YBL055CP34220 RTC3YHR087W 336 nt16.02■□□□□ 0.16
YBL055CP34220 RVS167YDR388W 1449 nt15.78■□□□□ 0.12
YBL055CP34220 SCJ1YMR214W 1134 nt15.7■□□□□ 0.1
YBL055CP34220 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.47■□□□□ 0.07
YBL055CP34220 PET122YER153C 765 nt15.45■□□□□ 0.06
YBL055CP34220 SCR1SCR1 522 nt15.21■□□□□ 0.03
YBL055CP34220 SHR5YOL110W 714 nt15.2■□□□□ 0.02
YBL055CP34220 ATS1YAL020C 1002 nt15.18■□□□□ 0.02
YBL055CP34220 SSA3YBL075C 1950 nt15.12■□□□□ 0.01
YBL055CP34220 PUT4YOR348C 1884 nt15.03■□□□□ -0
YBL055CP34220 RRN5YLR141W 1092 nt15□□□□□ -0.01
YBL055CP34220 YDJ1YNL064C 1230 nt14.95□□□□□ -0.02
YBL055CP34220 URN1YPR152C 1398 nt14.92□□□□□ -0.02
YBL055CP34220 DEP1YAL013W 1218 nt14.88□□□□□ -0.03
YBL055CP34220 OPI9YLR338W 858 nt14.74□□□□□ -0.05
YBL055CP34220 SAH1YER043C 1350 nt14.72□□□□□ -0.05
YBL055CP34220 ARE1YCR048W 1833 nt14.71□□□□□ -0.06
YBL055CP34220 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.69□□□□□ -0.06
YBL055CP34220 GAR1YHR089C 618 nt14.68□□□□□ -0.06
YBL055CP34220 RPN10YHR200W 807 nt14.62□□□□□ -0.07
YBL055CP34220 RSB1YOR049C 1065 nt14.62□□□□□ -0.07
YBL055CP34220 YNL208WYNL208W 600 nt14.59□□□□□ -0.07
YBL055CP34220 POA1YBR022W 534 nt14.57□□□□□ -0.08
YBL055CP34220 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.52□□□□□ -0.09
YBL055CP34220 PUN1YLR414C 792 nt14.3□□□□□ -0.12
YBL055CP34220 BSC6YOL137W 1494 nt14.28□□□□□ -0.12
YBL055CP34220 YJR018WYJR018W 363 nt14.22□□□□□ -0.13
YBL055CP34220 BUD23YCR047C 828 nt14.19□□□□□ -0.14
YBL055CP34220 TIR1YER011W 765 nt14.19□□□□□ -0.14
YBL055CP34220 PTC2YER089C 1395 nt14.19□□□□□ -0.14
YBL055CP34220 PST2YDR032C 597 nt14.11□□□□□ -0.15
YBL055CP34220 SSA1YAL005C 1929 nt14.07□□□□□ -0.16
YBL055CP34220 NAB2YGL122C 1578 nt14□□□□□ -0.17
YBL055CP34220 YJR120WYJR120W 351 nt13.97□□□□□ -0.17
YBL055CP34220 RPP2BYDR382W 333 nt13.85□□□□□ -0.19
YBL055CP34220 SRB2YHR041C 633 nt13.82□□□□□ -0.2
YBL055CP34220 SPT5YML010W 3192 nt13.79□□□□□ -0.2
YBL055CP34220 FIS1YIL065C 468 nt13.79□□□□□ -0.2
YBL055CP34220 DAL1YIR027C 1383 nt13.79□□□□□ -0.2
YBL055CP34220 FPR4YLR449W 1179 nt13.77□□□□□ -0.21
YBL055CP34220 INM2YDR287W 879 nt13.73□□□□□ -0.21
YBL055CP34220 PHO4YFR034C 939 nt13.66□□□□□ -0.22
YBL055CP34220 SHU1YHL006C 453 nt13.59□□□□□ -0.23
YBL055CP34220 SSA4YER103W 1929 nt13.58□□□□□ -0.24
YBL055CP34220 YBL100CYBL100C 315 nt13.57□□□□□ -0.24
YBL055CP34220 BDH2YAL061W 1254 nt13.56□□□□□ -0.24
YBL055CP34220 WWM1YFL010C 636 nt13.54□□□□□ -0.24
YBL055CP34220 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.47□□□□□ -0.25
YBL055CP34220 YPS1YLR120C 1710 nt13.47□□□□□ -0.25
YBL055CP34220 YKL097CYKL097C 411 nt13.42□□□□□ -0.26
YBL055CP34220 MEP2YNL142W 1500 nt13.42□□□□□ -0.26
YBL055CP34220 FUN26YAL022C 1554 nt13.41□□□□□ -0.26
YBL055CP34220 YGR021WYGR021W 873 nt13.36□□□□□ -0.27
YBL055CP34220 YDR095CYDR095C 411 nt13.35□□□□□ -0.27
YBL055CP34220 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.34□□□□□ -0.27
YBL055CP34220 LSM3YLR438C-A 270 nt13.34□□□□□ -0.27
YBL055CP34220 TRM9YML014W 840 nt13.34□□□□□ -0.27
YBL055CP34220 HOM6YJR139C 1080 nt13.32□□□□□ -0.28
YBL055CP34220 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.3□□□□□ -0.28
YBL055CP34220 ALF1YNL148C 765 nt13.25□□□□□ -0.29
YBL055CP34220 MNP1YGL068W 585 nt13.24□□□□□ -0.29
YBL055CP34220 DCW1YKL046C 1350 nt13.23□□□□□ -0.29
YBL055CP34220 CCT6YDR188W 1641 nt13.21□□□□□ -0.3
YBL055CP34220 RKM5YLR137W 1104 nt13.13□□□□□ -0.31
YBL055CP34220 BDF1YLR399C 2061 nt13.11□□□□□ -0.31
YBL055CP34220 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.1□□□□□ -0.31
YBL055CP34220 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.1□□□□□ -0.31
YBL055CP34220 RPP2AYOL039W 321 nt13.1□□□□□ -0.31
YBL055CP34220 PTP1YDL230W 1008 nt13.09□□□□□ -0.31
YBL055CP34220 SIS1YNL007C 1059 nt13.07□□□□□ -0.32
YBL055CP34220 EMI2YDR516C 1503 nt13.05□□□□□ -0.32
YBL055CP34220 CAC2YML102W 1407 nt13.03□□□□□ -0.32
YBL055CP34220 YOR139CYOR139C 393 nt12.95□□□□□ -0.34
YBL055CP34220 YMR090WYMR090W 684 nt12.94□□□□□ -0.34
YBL055CP34220 YDL221WYDL221W 552 nt12.93□□□□□ -0.34
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