Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FOXD3Q9UJU5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FOXD3Q9UJU5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms