Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PFDN5Q99471 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PFDN5Q99471 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms