RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000287507.7

BCKDK-202, Transcript of branched chain ketoacid dehydrogenase kinase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene BCKDK, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDK-202ENST00000287507 NISCHQ9Y2I1 1504 aa44.63■■■■■ 4.74
BCKDK-202ENST00000287507 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.88■■■■□ 3.81
BCKDK-202ENST00000287507 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.48■■■■□ 3.59
BCKDK-202ENST00000287507 DCAF8L2P0C7V8 631 aa37.05■■■■□ 3.52
BCKDK-202ENST00000287507 ABCC9O60706 1549 aa36.96■■■■□ 3.51
BCKDK-202ENST00000287507 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.89■■■■□ 3.5
BCKDK-202ENST00000287507 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa36.53■■■■□ 3.44
BCKDK-202ENST00000287507 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.42■■■■□ 3.42
BCKDK-202ENST00000287507 NACADO15069 1562 aa36.24■■■■□ 3.39
BCKDK-202ENST00000287507 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.97■■■■□ 3.35
BCKDK-202ENST00000287507 SCRIBQ14160 1630 aa35.87■■■■□ 3.33
BCKDK-202ENST00000287507 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.32■■■■□ 3.24
BCKDK-202ENST00000287507 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.26■■■■□ 3.23
BCKDK-202ENST00000287507 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.93■■■■□ 3.18
BCKDK-202ENST00000287507 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.18
BCKDK-202ENST00000287507 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.76■■■■□ 3.15
BCKDK-202ENST00000287507 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP34.7■■■■□ 3.15
BCKDK-202ENST00000287507 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.53■■■■□ 3.12
BCKDK-202ENST00000287507 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP34.45■■■■□ 3.11
BCKDK-202ENST00000287507 SMARCA4P51532 1647 aa34.33■■■■□ 3.09
BCKDK-202ENST00000287507 WIZO95785 1651 aa34.27■■■■□ 3.08
BCKDK-202ENST00000287507 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.88■■■■□ 3.01
BCKDK-202ENST00000287507 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.86■■■■□ 3.01
BCKDK-202ENST00000287507 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.83■■■■□ 3.01
BCKDK-202ENST00000287507 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.81■■■■□ 3
BCKDK-202ENST00000287507 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.78■■■■□ 3
BCKDK-202ENST00000287507 SMARCA2P51531 1590 aa33.72■■■□□ 2.99
BCKDK-202ENST00000287507 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.59■■■□□ 2.97
BCKDK-202ENST00000287507 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.54■■■□□ 2.96
BCKDK-202ENST00000287507 NCAPD3P42695 1498 aa33.47■■■□□ 2.95
BCKDK-202ENST00000287507 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.42■■■□□ 2.94
BCKDK-202ENST00000287507 HMGXB3Q12766 1538 aa33.4■■■□□ 2.94
BCKDK-202ENST00000287507 TRIM41Q8WV44 630 aa33.16■■■□□ 2.9
BCKDK-202ENST00000287507 ABCC8Q09428 1581 aa32.86■■■□□ 2.85
BCKDK-202ENST00000287507 CFTRP13569 1480 aa32.73■■■□□ 2.83
BCKDK-202ENST00000287507 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.72■■■□□ 2.83
BCKDK-202ENST00000287507 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP32.65■■■□□ 2.82
BCKDK-202ENST00000287507 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.64■■■□□ 2.82
BCKDK-202ENST00000287507 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP32.54■■■□□ 2.8
BCKDK-202ENST00000287507 PRDM2Q13029 1718 aa32.54■■■□□ 2.8
BCKDK-202ENST00000287507 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.53■■■□□ 2.8
BCKDK-202ENST00000287507 SYNJ1O43426 1573 aa32.49■■■□□ 2.79
BCKDK-202ENST00000287507 NESP48681 1621 aa32.45■■■□□ 2.79
BCKDK-202ENST00000287507 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.34■■■□□ 2.77
BCKDK-202ENST00000287507 TOP2BQ02880 1626 aa32.32■■■□□ 2.76
BCKDK-202ENST00000287507 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.29■■■□□ 2.76
BCKDK-202ENST00000287507 SOGA1O94964 1423 aa32.29■■■□□ 2.76
BCKDK-202ENST00000287507 CUX1P39880 1505 aa32.27■■■□□ 2.76
BCKDK-202ENST00000287507 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa32.27■■■□□ 2.76
BCKDK-202ENST00000287507 EEA1Q15075 1411 aa32.26■■■□□ 2.75
BCKDK-202ENST00000287507 CSRNP3Q8WYN3 585 aa32.14■■■□□ 2.74
BCKDK-202ENST00000287507 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.13■■■□□ 2.73
BCKDK-202ENST00000287507 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.1■■■□□ 2.73
BCKDK-202ENST00000287507 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.07■■■□□ 2.72
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BCKDK-202ENST00000287507 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.02■■■□□ 2.72
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BCKDK-202ENST00000287507 TOPBP1Q92547 1522 aa31.94■■■□□ 2.7
BCKDK-202ENST00000287507 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.93■■■□□ 2.7
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BCKDK-202ENST00000287507 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.78■■■□□ 2.68
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BCKDK-202ENST00000287507 KIF21BO75037 1637 aa31.75■■■□□ 2.67
BCKDK-202ENST00000287507 UBTFP17480 764 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
BCKDK-202ENST00000287507 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.73■■■□□ 2.67
BCKDK-202ENST00000287507 CUX2O14529 1486 aa31.72■■■□□ 2.67
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BCKDK-202ENST00000287507 ERCC6Q03468 1493 aa31.66■■■□□ 2.66
BCKDK-202ENST00000287507 PRXQ9BXM0 1461 aa31.63■■■□□ 2.65
BCKDK-202ENST00000287507 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.61■■■□□ 2.65
BCKDK-202ENST00000287507 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa31.6■■■□□ 2.65
BCKDK-202ENST00000287507 IGF1RP08069 1367 aa31.57■■■□□ 2.64
BCKDK-202ENST00000287507 CEP162Q5TB80 1403 aa31.56■■■□□ 2.64
BCKDK-202ENST00000287507 ERICH3Q5RHP9 1530 aa31.55■■■□□ 2.64
BCKDK-202ENST00000287507 WDR62O43379 1518 aa31.53■■■□□ 2.64
BCKDK-202ENST00000287507 WDR97A6NE52 1622 aa31.52■■■□□ 2.64
BCKDK-202ENST00000287507 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
BCKDK-202ENST00000287507 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
BCKDK-202ENST00000287507 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
BCKDK-202ENST00000287507 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa31.41■■■□□ 2.62
BCKDK-202ENST00000287507 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.36■■■□□ 2.61
BCKDK-202ENST00000287507 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.32■■■□□ 2.6
BCKDK-202ENST00000287507 CLIP1P30622 1438 aa31.31■■■□□ 2.6
BCKDK-202ENST00000287507 IFT140Q96RY7 1462 aa31.29■■■□□ 2.6
BCKDK-202ENST00000287507 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.24■■■□□ 2.592e-10■■■■□ 25.5
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BCKDK-202ENST00000287507 PCGF6Q9BYE7 350 aa31.16■■■□□ 2.58
BCKDK-202ENST00000287507 PBRM1Q86U86 1689 aa31.16■■■□□ 2.58
BCKDK-202ENST00000287507 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
BCKDK-202ENST00000287507 GRIN2BQ13224 1484 aa31.07■■■□□ 2.56
BCKDK-202ENST00000287507 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
BCKDK-202ENST00000287507 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.04■■■□□ 2.56
BCKDK-202ENST00000287507 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
BCKDK-202ENST00000287507 ADAMTS12P58397 1594 aa30.96■■■□□ 2.55
BCKDK-202ENST00000287507 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.96■■■□□ 2.55
BCKDK-202ENST00000287507 ARAP1Q96P48 1450 aa30.95■■■□□ 2.54
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