Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK2

SOHLH1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOHLH1Q5JUK2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOHLH1Q5JUK2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOHLH1Q5JUK2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms