RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343028.8

TM7SF3-201, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TM7SF3, Length 2,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-201ENST00000343028 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.8■■■■■ 4.12
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TM7SF3-201ENST00000343028 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.72■■■□□ 2.83
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TM7SF3-201ENST00000343028 NACADO15069 1562 aa32.17■■■□□ 2.74
TM7SF3-201ENST00000343028 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.08■■■□□ 2.73
TM7SF3-201ENST00000343028 CECR2Q9BXF3 1484 aa32■■■□□ 2.71
TM7SF3-201ENST00000343028 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.92■■■□□ 2.7
TM7SF3-201ENST00000343028 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.81■■■□□ 2.68
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TM7SF3-201ENST00000343028 TRIM41Q8WV44 630 aa31.71■■■□□ 2.67
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TM7SF3-201ENST00000343028 HRCP23327 699 aa31.34■■■□□ 2.61
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TM7SF3-201ENST00000343028 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.96■■■□□ 2.55
TM7SF3-201ENST00000343028 ABCC8Q09428 1581 aa30.91■■■□□ 2.54
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TM7SF3-201ENST00000343028 SOGA1O94964 1423 aa30.55■■■□□ 2.48
TM7SF3-201ENST00000343028 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.45■■■□□ 2.46
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TM7SF3-201ENST00000343028 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
TM7SF3-201ENST00000343028 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.41■■■□□ 2.46
TM7SF3-201ENST00000343028 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
TM7SF3-201ENST00000343028 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.31■■■□□ 2.44
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TM7SF3-201ENST00000343028 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.31■■■□□ 2.44
TM7SF3-201ENST00000343028 CEP162Q5TB80 1403 aa30.21■■■□□ 2.43
TM7SF3-201ENST00000343028 SYNJ1O43426 1573 aa30.18■■■□□ 2.42
TM7SF3-201ENST00000343028 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.09■■■□□ 2.41
TM7SF3-201ENST00000343028 EEA1Q15075 1411 aa30.08■■■□□ 2.41
TM7SF3-201ENST00000343028 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
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TM7SF3-201ENST00000343028 KIF27Q86VH2 1401 aa29.38■■■□□ 2.29
TM7SF3-201ENST00000343028 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.34■■■□□ 2.29
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TM7SF3-201ENST00000343028 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
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TM7SF3-201ENST00000343028 NESP48681 1621 aa29.08■■■□□ 2.25
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TM7SF3-201ENST00000343028 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.97■■■□□ 2.23
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TM7SF3-201ENST00000343028 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.79■■■□□ 2.2
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TM7SF3-201ENST00000343028 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
TM7SF3-201ENST00000343028 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
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TM7SF3-201ENST00000343028 FHOD3Q2V2M9 1422 aa28.66■■■□□ 2.18
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