Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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RRN3P1Q2M238 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RRN3P1Q2M238 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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