Protein–RNA interactions for Protein: Q06106

MRD1, Multiple RNA-binding domain-containing protein 1, yeast

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRD1	Q06106	YRB1	YDR002W	606 nt		2.46	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	VAR1	Q0140	1197 nt		2.46	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	EMP24	YGL200C	612 nt		2.46	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	TPM2	YIL138C	486 nt		2.46	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	HYR1	YIR037W	492 nt		2.46	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YNL018C	YNL018C	1839 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	KOG1	YHR186C	4674 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	SSY1	YDR160W	2559 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	DNF1	YER166W	4716 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YFH1	YDL120W	525 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YEL030C-A	YEL030C-A	315 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	CAJ1	YER048C	1176 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YER119C-A	YER119C-A	372 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YGL165C	YGL165C	579 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YIL030W-A	YIL030W-A	339 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YJL052C-A	YJL052C-A	120 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	PEP8	YJL053W	1140 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	CMS1	YLR003C	876 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	IGO1	YNL157W	507 nt		2.45	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	RGL1	YPL066W	1440 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	STH1	YIL126W	4080 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YGR045C	YGR045C	363 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	RPL16A	YIL133C	600 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YJR157W	YJR157W	363 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	SPC29	YPL124W	762 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	MSS18	YPR134W	807 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	INP51	YIL002C	2841 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	IRC8	YJL051W	2469 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	RGA2	YDR379W	3030 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	INO80	YGL150C	4470 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	ROY1	YMR258C	1662 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YJL070C	YJL070C	2667 nt		2.44	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	ASG1	YIL130W	2895 nt		2.43	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	MXR1	YER042W	555 nt		2.43	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	RAM2	YKL019W	951 nt		2.43	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	HSC82	YMR186W	2118 nt		2.43	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	GPI15	YNL038W	690 nt		2.43	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	RPB11	YOL005C	363 nt		2.43	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	MGR1	YCL044C	1254 nt		2.43	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YIL080W	YIL080W	4722 nt		2.43	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	MDM32	YOR147W	1869 nt		2.43	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	VPS16	YPL045W	2397 nt		2.43	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	ACB1	YGR037C	264 nt		2.42	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	RNR4	YGR180C	1038 nt		2.42	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YAP3	YHL009C	993 nt		2.42	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YAL059C-A	YAL059C-A	423 nt		2.42	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	URA10	YMR271C	684 nt		2.42	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	RUF22	RUF22	515 nt		2.42	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YPL197C	YPL197C	414 nt		2.42	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	VMA9	YCL005W-A	222 nt		2.42	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	RRP12	YPL012W	3687 nt		2.41	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	SAP185	YJL098W	3177 nt		2.41	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YCR001W	YCR001W	315 nt		2.41	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	TIM9	YEL020W-A	264 nt		2.41	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	PET191	YJR034W	327 nt		2.41	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	YLR222C-A	YLR222C-A	231 nt		2.41	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	PBI2	YNL015W	228 nt		2.41	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	BRO1	YPL084W	2535 nt		2.41	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	GUP1	YGL084C	1683 nt		2.41	□□□□□ -2.02
MRD1	Q06106	SMB1	YER029C	591 nt		2.4	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YLR458W	YLR458W	381 nt		2.4	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	ATX2	YOR079C	942 nt		2.4	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	BRE1	YDL074C	2103 nt		2.39	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YEL043W	YEL043W	2871 nt		2.39	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	SDC1	YDR469W	528 nt		2.39	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YHR130C	YHR130C	336 nt		2.39	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YLR379W	YLR379W	375 nt		2.39	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	DDR48	YMR173W	1293 nt		2.39	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	NOP15	YNL110C	663 nt		2.39	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	DAD4	YDR320C-A	219 nt		2.38	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	TWF1	YGR080W	999 nt		2.38	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YJL127C-B	YJL127C-B	159 nt		2.38	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YJR140W-A	YJR140W-A	150 nt		2.38	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YKL068W-A	YKL068W-A	237 nt		2.38	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YOR105W	YOR105W	327 nt		2.38	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	GIS1	YDR096W	2685 nt		2.38	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	GYP5	YPL249C	2685 nt		2.38	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	TOR2	YKL203C	7425 nt		2.38	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	RGA1	YOR127W	3024 nt		2.38	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YOR192C-A	YOR192C-A	1317 nt		2.38	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	ATG11	YPR049C	3537 nt		2.38	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	UBP11	YKR098C	2154 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	NUP100	YKL068W	2880 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	PTC5	YOR090C	1719 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YFR056C	YFR056C	369 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YPS5	YGL259W	498 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	LCL2	YLR104W	396 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	PKR1	YMR123W	369 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	SIP18	YMR175W	240 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YMR320W	YMR320W	306 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	RPS7B	YNL096C	573 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	MF(ALPHA)1	YPL187W	498 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	IRC16	YPR038W	360 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YBR277C	YBR277C	402 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	AFI1	YOR129C	2682 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	CBF2	YGR140W	2871 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	REV3	YPL167C	4515 nt		2.37	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	YFR016C	YFR016C	3702 nt		2.36	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	RPL27B	YDR471W	411 nt		2.36	□□□□□ -2.03
MRD1	Q06106	PRE4	YFR050C	801 nt		2.36	□□□□□ -2.03

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 64 ms