Protein–RNA interactions for Protein: Q01196

RUNX1, Runt-related transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1Q01196 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RUNX1Q01196 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms