Protein–RNA interactions for Protein: P38842

YHR140W, UPF0641 membrane protein YHR140W, yeastyeast

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHR140WP38842 SDL1YIL167W 633 nt0.92□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 TAP42YMR028W 1101 nt0.92□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 LSM7YNL147W 348 nt0.92□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 YNL171CYNL171C 369 nt0.92□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 IZH4YOL101C 939 nt0.92□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 YBR090CYBR090C 369 nt0.92□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 VID24YBR105C 1089 nt0.92□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 MSH5YDL154W 2706 nt0.92□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 YLR422WYLR422W 5799 nt0.92□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 YGR250CYGR250C 2346 nt0.92□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 CTF13YMR094W 1437 nt0.91□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 LAA1YJL207C 6045 nt0.91□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 SLK19YOR195W 2466 nt0.91□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 FSH1YHR049W 732 nt0.91□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 YJL022WYJL022W 309 nt0.91□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 VPS25YJR102C 609 nt0.91□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 YNR021WYNR021W 1215 nt0.91□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.91□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt0.91□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 YPR146CYPR146C 330 nt0.91□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 MDS3YGL197W 4464 nt0.91□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 DAS1YJL149W 1992 nt0.9□□□□□ -2.26
YHR140WP38842 MUK1YPL070W 1839 nt0.9□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 SLD5YDR489W 885 nt0.9□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 PRS3YHL011C 963 nt0.9□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 VPS55YJR044C 423 nt0.9□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 HSK3YKL138C-A 210 nt0.9□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 NEJ1YLR265C 1029 nt0.9□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 MSH3YCR092C 3057 nt0.9□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 ARP5YNL059C 2268 nt0.89□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 LSM4YER112W 564 nt0.89□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YKL115CYKL115C 393 nt0.89□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt0.89□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YPR063CYPR063C 423 nt0.89□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 SHG1YBR258C 429 nt0.89□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 SPT7YBR081C 3999 nt0.89□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 REV3YPL167C 4515 nt0.88□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YIP1YGR172C 747 nt0.88□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt0.88□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 COX6YHR051W 447 nt0.88□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 COF1YLL050C 432 nt0.88□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 RPB11YOL005C 363 nt0.88□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YOL085W-AYOL085W-A 213 nt0.88□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 TRS20YBR254C 528 nt0.88□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 VAM6YDL077C 3150 nt0.88□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 CAJ1YER048C 1176 nt0.87□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 RPL34BYIL052C 366 nt0.87□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 UFD2YDL190C 2886 nt0.87□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 BI3Q0115 1554 nt0.87□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 SNF5YBR289W 2718 nt0.87□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 SPO75YLL005C 2607 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 RIC1YLR039C 3171 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 RPS26BYER131W 360 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 IMP3YHR148W 552 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 SEC28YIL076W 891 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 HYR1YIR037W 492 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 RFA3YJL173C 369 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 IRC19YLL033W 693 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 NOP15YNL110C 663 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YNL226WYNL226W 411 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YOL118CYOL118C 309 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 snR34snR34 203 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 MGR1YCL044C 1254 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 MNL2YLR057W 2550 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 SEC3YER008C 4011 nt0.86□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 SMY1YKL079W 1971 nt0.85□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YDR336WYDR336W 945 nt0.85□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 RPN9YDR427W 1182 nt0.85□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.85□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 GSP1YLR293C 660 nt0.85□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 PGA1YNL158W 597 nt0.85□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 CUR1YPR158W 759 nt0.85□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 RRI1YDL216C 1323 nt0.85□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 DGR2YKL121W 2559 nt0.85□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 CDC27YBL084C 2277 nt0.84□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 MIC19YFR011C 513 nt0.84□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YHL037CYHL037C 402 nt0.84□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YLR458WYLR458W 381 nt0.84□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 TIF11YMR260C 462 nt0.84□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 SFG1YOR315W 1041 nt0.84□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 YBR062CYBR062C 543 nt0.84□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 ICS2YBR157C 768 nt0.84□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 PEX34YCL056C 435 nt0.84□□□□□ -2.27
YHR140WP38842 DOT6YER088C 2013 nt0.84□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 RLM1YPL089C 2031 nt0.84□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 MVP1YMR004W 1536 nt0.84□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 MSC6YOR354C 2079 nt0.84□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 YDR262WYDR262W 819 nt0.83□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.83□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.83□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.83□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.83□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.83□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt0.83□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt0.83□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 SPC1YJR010C-A 285 nt0.83□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 ATG16YMR159C 453 nt0.83□□□□□ -2.28
YHR140WP38842 PET20YPL159C 762 nt0.83□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.1 ms