Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
AP4B1Q9Y6B7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
AP4B1Q9Y6B7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
AP4B1Q9Y6B7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AP4B1Q9Y6B7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
AP4B1Q9Y6B7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms