Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CFAP20Q9Y6A4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP20Q9Y6A4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP20Q9Y6A4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP20Q9Y6A4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP20Q9Y6A4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP20Q9Y6A4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CFAP20Q9Y6A4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP20Q9Y6A4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP20Q9Y6A4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP20Q9Y6A4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP20Q9Y6A4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CFAP20Q9Y6A4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP20Q9Y6A4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CFAP20Q9Y6A4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CFAP20Q9Y6A4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CFAP20Q9Y6A4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CFAP20Q9Y6A4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP20Q9Y6A4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CFAP20Q9Y6A4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CFAP20Q9Y6A4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP20Q9Y6A4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CFAP20Q9Y6A4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP20Q9Y6A4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP20Q9Y6A4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP20Q9Y6A4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP20Q9Y6A4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CFAP20Q9Y6A4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CFAP20Q9Y6A4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CFAP20Q9Y6A4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms