Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NR2E3Q9Y5X4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
NR2E3Q9Y5X4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NR2E3Q9Y5X4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
NR2E3Q9Y5X4 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
NR2E3Q9Y5X4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NR2E3Q9Y5X4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
NR2E3Q9Y5X4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NR2E3Q9Y5X4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NR2E3Q9Y5X4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NR2E3Q9Y5X4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
NR2E3Q9Y5X4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NR2E3Q9Y5X4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
NR2E3Q9Y5X4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
NR2E3Q9Y5X4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR2E3Q9Y5X4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR2E3Q9Y5X4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
NR2E3Q9Y5X4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NR2E3Q9Y5X4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
NR2E3Q9Y5X4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NR2E3Q9Y5X4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
NR2E3Q9Y5X4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NR2E3Q9Y5X4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NR2E3Q9Y5X4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
NR2E3Q9Y5X4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
NR2E3Q9Y5X4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
NR2E3Q9Y5X4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NR2E3Q9Y5X4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
NR2E3Q9Y5X4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NR2E3Q9Y5X4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
NR2E3Q9Y5X4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NR2E3Q9Y5X4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NR2E3Q9Y5X4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NR2E3Q9Y5X4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NR2E3Q9Y5X4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NR2E3Q9Y5X4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NR2E3Q9Y5X4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
NR2E3Q9Y5X4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NR2E3Q9Y5X4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NR2E3Q9Y5X4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms