Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB5Q9Y5E4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB5Q9Y5E4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHB5Q9Y5E4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB5Q9Y5E4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB5Q9Y5E4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB5Q9Y5E4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB5Q9Y5E4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB5Q9Y5E4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB5Q9Y5E4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB5Q9Y5E4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB5Q9Y5E4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB5Q9Y5E4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB5Q9Y5E4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB5Q9Y5E4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB5Q9Y5E4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB5Q9Y5E4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB5Q9Y5E4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB5Q9Y5E4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB5Q9Y5E4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB5Q9Y5E4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB5Q9Y5E4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB5Q9Y5E4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB5Q9Y5E4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB5Q9Y5E4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB5Q9Y5E4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms