Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
RAD54L2Q9Y4B4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC45.08■■■■■ 4.81
RAD54L2Q9Y4B4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
RAD54L2Q9Y4B4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
RAD54L2Q9Y4B4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
RAD54L2Q9Y4B4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
RAD54L2Q9Y4B4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
RAD54L2Q9Y4B4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
RAD54L2Q9Y4B4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
RAD54L2Q9Y4B4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
RAD54L2Q9Y4B4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
RAD54L2Q9Y4B4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
RAD54L2Q9Y4B4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
RAD54L2Q9Y4B4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
RAD54L2Q9Y4B4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
RAD54L2Q9Y4B4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.98■■■■■ 4.79
RAD54L2Q9Y4B4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.98■■■■■ 4.79
RAD54L2Q9Y4B4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
RAD54L2Q9Y4B4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
RAD54L2Q9Y4B4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.93■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC44.91■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
RAD54L2Q9Y4B4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
RAD54L2Q9Y4B4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
RAD54L2Q9Y4B4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.87■■■■■ 4.77
RAD54L2Q9Y4B4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
RAD54L2Q9Y4B4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.86■■■■■ 4.77
RAD54L2Q9Y4B4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.85■■■■■ 4.77
RAD54L2Q9Y4B4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
RAD54L2Q9Y4B4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
RAD54L2Q9Y4B4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
RAD54L2Q9Y4B4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC44.82■■■■■ 4.77
RAD54L2Q9Y4B4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.81■■■■■ 4.76
RAD54L2Q9Y4B4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
RAD54L2Q9Y4B4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC44.8■■■■■ 4.76
RAD54L2Q9Y4B4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
RAD54L2Q9Y4B4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
RAD54L2Q9Y4B4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.77■■■■■ 4.76
RAD54L2Q9Y4B4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
RAD54L2Q9Y4B4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
RAD54L2Q9Y4B4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
RAD54L2Q9Y4B4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
RAD54L2Q9Y4B4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RAD54L2Q9Y4B4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RAD54L2Q9Y4B4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RAD54L2Q9Y4B4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC44.69■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC44.69■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC44.64■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.74
RAD54L2Q9Y4B4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC44.62■■■■■ 4.73
RAD54L2Q9Y4B4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC44.59■■■■■ 4.73
RAD54L2Q9Y4B4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC44.58■■■■■ 4.73
RAD54L2Q9Y4B4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.56■■■■■ 4.72
RAD54L2Q9Y4B4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC44.55■■■■■ 4.72
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RAD54L2Q9Y4B4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.53■■■■■ 4.72
RAD54L2Q9Y4B4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RAD54L2Q9Y4B4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.53■■■■■ 4.72
RAD54L2Q9Y4B4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
RAD54L2Q9Y4B4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC44.51■■■■■ 4.72
RAD54L2Q9Y4B4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.5■■■■■ 4.71
RAD54L2Q9Y4B4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC44.49■■■■■ 4.71
RAD54L2Q9Y4B4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC44.47■■■■■ 4.71
RAD54L2Q9Y4B4 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.47■■■■■ 4.71
RAD54L2Q9Y4B4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC44.46■■■■■ 4.71
RAD54L2Q9Y4B4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
RAD54L2Q9Y4B4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC44.45■■■■■ 4.71
RAD54L2Q9Y4B4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.71
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC44.44■■■■■ 4.7
RAD54L2Q9Y4B4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC44.43■■■■■ 4.7
RAD54L2Q9Y4B4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
RAD54L2Q9Y4B4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC44.42■■■■■ 4.7
RAD54L2Q9Y4B4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC44.41■■■■■ 4.7
RAD54L2Q9Y4B4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
RAD54L2Q9Y4B4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.4■■■■■ 4.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms