Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
UBE2J1Q9Y385 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBE2J1Q9Y385 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE2J1Q9Y385 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
UBE2J1Q9Y385 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UBE2J1Q9Y385 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms