Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPS28Q9Y2Q9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPS28Q9Y2Q9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRPS28Q9Y2Q9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS28Q9Y2Q9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MRPS28Q9Y2Q9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS28Q9Y2Q9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MRPS28Q9Y2Q9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
MRPS28Q9Y2Q9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPS28Q9Y2Q9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPS28Q9Y2Q9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS28Q9Y2Q9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms