Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FARSAQ9Y285 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FARSAQ9Y285 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FARSAQ9Y285 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FARSAQ9Y285 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FARSAQ9Y285 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms