Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y279

VSIG4, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG4Q9Y279 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VSIG4Q9Y279 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VSIG4Q9Y279 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VSIG4Q9Y279 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VSIG4Q9Y279 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VSIG4Q9Y279 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VSIG4Q9Y279 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms