Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPC6Q9Y210 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPC6Q9Y210 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRPC6Q9Y210 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPC6Q9Y210 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPC6Q9Y210 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRPC6Q9Y210 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPC6Q9Y210 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRPC6Q9Y210 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
TRPC6Q9Y210 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRPC6Q9Y210 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRPC6Q9Y210 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRPC6Q9Y210 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRPC6Q9Y210 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRPC6Q9Y210 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPC6Q9Y210 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPC6Q9Y210 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRPC6Q9Y210 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRPC6Q9Y210 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPC6Q9Y210 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TRPC6Q9Y210 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TRPC6Q9Y210 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPC6Q9Y210 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPC6Q9Y210 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TRPC6Q9Y210 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPC6Q9Y210 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TRPC6Q9Y210 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TRPC6Q9Y210 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TRPC6Q9Y210 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TRPC6Q9Y210 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRPC6Q9Y210 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TRPC6Q9Y210 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TRPC6Q9Y210 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRPC6Q9Y210 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPC6Q9Y210 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms