Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SHOC2Q9UQ13 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SHOC2Q9UQ13 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHOC2Q9UQ13 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SHOC2Q9UQ13 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SHOC2Q9UQ13 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SHOC2Q9UQ13 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHOC2Q9UQ13 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms