Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNRF3Q9ULT6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ZNRF3Q9ULT6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNRF3Q9ULT6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNRF3Q9ULT6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNRF3Q9ULT6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNRF3Q9ULT6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNRF3Q9ULT6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNRF3Q9ULT6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNRF3Q9ULT6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNRF3Q9ULT6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNRF3Q9ULT6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNRF3Q9ULT6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNRF3Q9ULT6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNRF3Q9ULT6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNRF3Q9ULT6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNRF3Q9ULT6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNRF3Q9ULT6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNRF3Q9ULT6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNRF3Q9ULT6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNRF3Q9ULT6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNRF3Q9ULT6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNRF3Q9ULT6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNRF3Q9ULT6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNRF3Q9ULT6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZNRF3Q9ULT6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZNRF3Q9ULT6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNRF3Q9ULT6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNRF3Q9ULT6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNRF3Q9ULT6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNRF3Q9ULT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ZNRF3Q9ULT6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
ZNRF3Q9ULT6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
ZNRF3Q9ULT6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNRF3Q9ULT6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNRF3Q9ULT6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
ZNRF3Q9ULT6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNRF3Q9ULT6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
ZNRF3Q9ULT6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
ZNRF3Q9ULT6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNRF3Q9ULT6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNRF3Q9ULT6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
ZNRF3Q9ULT6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNRF3Q9ULT6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
ZNRF3Q9ULT6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNRF3Q9ULT6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNRF3Q9ULT6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNRF3Q9ULT6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNRF3Q9ULT6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNRF3Q9ULT6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNRF3Q9ULT6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ZNRF3Q9ULT6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
ZNRF3Q9ULT6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms