Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PILRAQ9UKJ1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PILRAQ9UKJ1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PILRAQ9UKJ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PILRAQ9UKJ1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PILRAQ9UKJ1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PILRAQ9UKJ1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PILRAQ9UKJ1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PILRAQ9UKJ1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms