Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH03

SEPT3, Neuronal-specific septin-3, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEPT3Q9UH03 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SEPT3Q9UH03 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEPT3Q9UH03 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SEPT3Q9UH03 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SEPT3Q9UH03 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEPT3Q9UH03 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SEPT3Q9UH03 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SEPT3Q9UH03 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SEPT3Q9UH03 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SEPT3Q9UH03 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SEPT3Q9UH03 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SEPT3Q9UH03 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SEPT3Q9UH03 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEPT3Q9UH03 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SEPT3Q9UH03 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEPT3Q9UH03 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEPT3Q9UH03 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SEPT3Q9UH03 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEPT3Q9UH03 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SEPT3Q9UH03 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEPT3Q9UH03 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SEPT3Q9UH03 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SEPT3Q9UH03 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms