Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
USP35Q9P2H5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
USP35Q9P2H5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
USP35Q9P2H5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
USP35Q9P2H5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
USP35Q9P2H5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
USP35Q9P2H5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
USP35Q9P2H5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
USP35Q9P2H5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
USP35Q9P2H5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
USP35Q9P2H5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
USP35Q9P2H5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
USP35Q9P2H5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
USP35Q9P2H5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
USP35Q9P2H5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
USP35Q9P2H5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
USP35Q9P2H5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
USP35Q9P2H5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
USP35Q9P2H5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
USP35Q9P2H5 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
USP35Q9P2H5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
USP35Q9P2H5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
USP35Q9P2H5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
USP35Q9P2H5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
USP35Q9P2H5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
USP35Q9P2H5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
USP35Q9P2H5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
USP35Q9P2H5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
USP35Q9P2H5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
USP35Q9P2H5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
USP35Q9P2H5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
USP35Q9P2H5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
USP35Q9P2H5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
USP35Q9P2H5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
USP35Q9P2H5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
USP35Q9P2H5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
USP35Q9P2H5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
USP35Q9P2H5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
USP35Q9P2H5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
USP35Q9P2H5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
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