Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RCC2Q9P258 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RCC2Q9P258 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RCC2Q9P258 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RCC2Q9P258 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms